Виртуальная эндоскопия (ATB)

Проект является дипломной работой студентов направления "Прикладная математика и информатика" БФУ им.Канта:

• Даниила Верёвкина
• Дмитрия Собинина
• Мельникова Саввы

Цель: разработать веб-приложение для исследования сосудов методом виртуальной эндоскопии.

Процесс сборки приложения

Установка и настройка приложения состоит из двух частей:

• Сборка backend (ATB)
• Сборка react frontend

Сборка backend

Backend - набор docker-слоев, которые поочередно надо собрать и запустить контейнер, который будет принимать по указанному порту данные для обработки кадров.

1. Сборка базовых слоев

Базовые слои - слои с библиотеками, которые необходимы для работы разрабатываемого приложения ArterialTreeBuilder. В директории /bootstrap находятся Dockerfile'ы формата Dockerfile.u.*уровень_слоя*. В каждом таком файле имеется комментарий с командой сборки каждого фрейма слоя. Эти команды необходимо выполнять поочередно из корня проекта. Каждый последующий слой зависит от предыдущего.

2. Сборка слоя с приложением

Слой приложения - слой со скомпилированным кодом разрабатываемой программы. Для сборки такого слоя необходимо собрать все фреймы базовых слоев, на основе которых мы собираем рабочий слой, добавляя к базовым слоям наш слой приложения. Для сборки этого слоя необходимо выполнить скрипт bootstrap/build-pea-atb.sh. Далее можно запускать docker контейнер на основе полученной стопки слоев и стучаться к порту 8889 (возможно изменить при необходимости) (надо добавить команду запуска контейнера).

Сборка frontend

Веб-интерфейс разрабатывается на основе связки VITE & React & TypeScript

Все файлы и директории, помеченные префиксом old_*, неактуальны, и используются в проекте, как пример.

Зависимости:

• https://github.com/FNNDSC/ami - Чтение и рендер DICOM файлов