-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
Expand file tree
/
Copy pathDecisionTree.py
More file actions
244 lines (187 loc) · 9.69 KB
/
DecisionTree.py
File metadata and controls
244 lines (187 loc) · 9.69 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
# -*- coding: utf-8 -*-
import sys
from Predicate import Predicate
__author__ = 'popka'
import numpy as np
from random import randint
from Impurity.Gini import Gini
from Impurity.RegressionImpurity import RegressionImpurity
from Node import Node
from Splitter import Splitter
import traceback
import time
from Splitter_C import Splitter
class DecisionTree():
def __init__(self, is_classification=True, impurity=None, max_depth=10, min_samples_leaf=1, max_features=25, min_features=5, max_steps=100, rsm=True):
"""
Моя собственная, любимая реализация CART
:param is_classification: True, если задача классификации,
False, если задача регрессии
:param impurity: Объект, реализующий интерфейс Impurity.
Если None, то Gini для классификации и среднеквадратичное отклонение для регрессии
:param min_samples_leaf: количество объектов, при достижении которого в узле, узел перестает делиться и становится листом
:param min_impurity: минимальное impurity, при достижении которого в узле, узел перестает делиться и становится листом
:param max_features: максимальное количество фичей, которое будет просмотрено в каждом листе
:param max_steps: максимальное количество комбинаций, которое будет просмотрено
при делении качественного признака во время поиска оптимального разделения
"""
self._impurity = impurity
self._is_classification = is_classification
self._min_samples_leaf = min_samples_leaf
self._max_features = max_features
self._min_features = min_features
self._max_steps = max_steps
if max_depth is None:
self._max_depth = sys.maxint
else:
self._max_depth = max_depth
self._rsm = rsm
if self._is_classification:
if impurity is None:
self._impurity = Gini()
else:
if impurity is None:
self._impurity = RegressionImpurity()
self._root = None
self._splitter = Splitter()
def fit(self, X_, y_):
y = np.copy(np.asarray(y_, dtype=float))
X = np.copy(np.matrix(X_, dtype=float))
self._build_tree(X, y)
def _build_tree(self, X, y):
depth = 1
if not self._is_stop_criterion(y, depth) > 0:
predicate = self.select_predicate(X, y)
self._root = Node(predicate=predicate)
X_left, y_left, X_right, y_right = self._root.predicate.split_by_predicate(X, y)
self._root.left_node = self._create_node(X_left, y_left, depth=depth+1)
self._root.right_node = self._create_node(X_right, y_right, depth=depth+1)
else:
self._root = Node(is_leaf=True, value=self._select_leaf_value(y))
def _create_node(self, X, y, depth):
"""
Построение дерева
:param X:
:param y:
"""
if not self._is_stop_criterion(y, depth):
predicate = self.select_predicate(X, y)
if predicate is None:
# если не удалось выбрать предикат. Такое может быть если все значения X одинаковы.
value = self._select_leaf_value(y)
return Node(predicate=None, is_leaf=True, value=value)
node = Node(predicate=predicate)
X_left, y_left, X_right, y_right = node.predicate.split_by_predicate(X, y)
if len(y_left) == 0 or len(y_right) == 0:
"""
Если оптимальным считается разделить узел так, что в одной части будут значения, а в другой - нет
(это может случится, когда все значения признака одинаковые), считаем, что это лист
"""
value = self._select_leaf_value(y)
return Node(predicate=None, is_leaf=True, value=value)
node.left_node = self._create_node(X_left, y_left, depth=depth+1)
node.right_node = self._create_node(X_right, y_right, depth+1)
return node
else:
value = self._select_leaf_value(y)
return Node(predicate=None, is_leaf=True, value=value)
def _select_leaf_value(self, y):
"""
Функция вычисляет и возвращает значение, которое будет находиться в листе
:param y:
"""
try:
if self._is_classification:
counts = np.bincount(y)
value = np.argmax(counts)
else:
value = np.mean(y)
return value
except Exception:
traceback.print_exc()
print y
def _is_stop_criterion(self, y, depth):
"""
Критерий останова.
Пока прос
:param y:
:return:
"""
return depth > self._max_depth or \
len(y) < self._min_samples_leaf
#depth > self._max_depth# or \
#self._impurity.calculate_node(y) <= self._min_impurity
def select_predicate(self, X, y):
"""
Функция выбирает оптимальный предикат и возвращает его
:param X:
:param y:
:return:
"""
if (self._rsm):
feature_indexes = DecisionTree.get_rsm_features(max(min(X.shape[1], self._max_features), self._min_features)) # Массив индексов фичей (какие столбцы будем просматривать)
else:
feature_indexes = np.asarray([i for i in range(X.shape[1])])
max_delta_impurity = None
best_feature_index = None
for feature_index in feature_indexes:
x = X[:,feature_index] # Столбец значений фичи (значения фичи для всех объектов)
"""
Заккоментирую, чтобы работало быстрее
if DecisionTree._is_categorical(x):
type = Predicate.CAT
value, delta_impurity = self._splitter.split_categorial(x=x, y=y, impurity=self._impurity)
else:
"""
type = Predicate.QUAN
value, delta_impurity = self._splitter.split_quick_quantitative(x=x, y=y, impurity=self._impurity)
if max_delta_impurity < delta_impurity:
max_delta_impurity = delta_impurity
best_feature_index = feature_index
best_value = value
if best_feature_index is None:
return None # Разделяющая фича не найдена. Например, если все значения фичей одинаковы. Для RSM такое возможно
return Predicate(type=type, feature_id=best_feature_index, value=best_value, gain=max_delta_impurity)
def predict(self, X):
y = np.zeros(len(X))
for i in range(len(X)):
x = X[i]
node = self._root
while(not node.is_leaf):
node = node.get_next_node(x)
y[i] = node.value
if self._is_classification:
return y.astype(int)
else:
return y
#TODO:
"""
Чтобы получить число размещений, нужно перебрать поочередно все варианты. Например, для 4-х классов будет
2^4-2 вариантов, бинарно закадированными. [0001, 0010, 0011, 0100..., 1110]
Считаем все варианты и выбираем разбиение
Здесь напрашивается фича max_feature, наконец стало понятно, что это за параметр.
"""
@staticmethod
def _is_categorical(x, max_categorial_feature_length=7):
"""
Предполагаем, что категориальная фича должна быть:
целой,
меньше длины max_categorial_feature_length,
:param x: столбец фичи
:param max_categorial_feature_length: максимально возможная длина категориальный фичи. Чтобы не офигеть от количества вариантов
:return:
"""
if 'int' in str(x.dtype):
if len(np.unique(x)) < max_categorial_feature_length:
return True
return False
@staticmethod
def get_rsm_features(feature_count):
"""
Функция релизует random subspace method - возвращает массив случайной длины со случайными значениями, не превосходящими feature_count
:param feature_count:
"""
# TODO: Возможно имеет смысл ввести min_feature_count,
rand_array = np.random.randint(feature_count, size=randint(1, feature_count))
rand_array = np.unique(rand_array)
return rand_array