design部分接口

[cairijun]

• POST /circuit/schemes

  根据真值表设计通路

  请求：

  {
    "inputs": [
      { "receptor_id": 1, "id": 1, "promoter_id": 17 }, 
      { "receptor_id": 3, "id": 2, "promoter_id": 23 }
    ], 
    "truth_table": [
      { "inputs": [ true, true ], "outputs": [ true, true ] }, 
      { "inputs": [ false, true ], "outputs": [ false, true ] }, 
      { "inputs": [ true, false ], "outputs": [ false, true ] }, 
      { "inputs": [ false, false ], "outputs": [ false, false ] }
    ], 
    "outputs": [ 2, 4 ]
  }

  响应：

  {
    "inputs": [
      [{/* input */}, {/* receptor */}],
      [{/* input */}, {/* receptor */}]
    ],
    "logics": [
      [{/* candidate for output 1 */}, {/* candidate for output 1 */}],
      [{/* candidate for output 2 */}, {/* candidate for output 2 */}]
    ]
  }

• POST /circuit/details

  在拖放模式下，根据用户选择的基本结构生成详细信息

  请求：

  {
    "inputs": [
      { "receptor_id": 12, "id": 8, "promoter_id": 1 }, 
      { "receptor_id": 13, "id": 9, "promoter_id": 17 }
    ], 
    "logics": [ 23, 21 ], 
    "outputs": [ 1, 2 ]
  }

  响应：（与上面接口类似）

  {
    "inputs": [
      [{/* input */}, {/* receptor */}],
      [{/* input */}, {/* receptor */}]
    ],
    "logics": [
      {/* logic for output 1 */},
      {/* logic for output 2 */}
    ]
  }

• 注意

  1. 在input中有一个字段relationship指定该input-receptor-promoter组之间的关系。
     "PROMOTE"表示input和receptor结合对promoter起促进作用
     "REPRESS"表示input和receptor结合对promoter起抑制作用
     "BIREPRESS"表示input解除receptor对promoter的抑制作用
  2. logic中inputpart的数量不一定与输入数量相等，outputpart的数量不一定与输出数量相等，不同类型的logic有不同的结构
  3. eid字段原本设计来是为了方便表示通路间的调控关系，但是现在不需要了，后面可能会取消eid字段

更多例子请见相关单元测试。

[cairijun]

POST /circuit/details的返回值增加一个字段dna_export，是一个字符串，表示导出DNA的结果。
前端可以用HTML的download属性实现下载功能。
详见 http://stackoverflow.com/questions/2897619/using-html5-javascript-to-generate-and-save-a-file 中第二个和第三个回答
后端有需要修改的地方在github上说一下