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#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT HG00702 HG00657 HG00656
1 24009497 . A C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62898;AF=0.9;EAS_AF=1;EUR_AF=0.93;AFR_AF=0.73;AMR_AF=0.95;SAS_AF=0.93;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
1 110273330 . T A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=77286;AF=0.34;EAS_AF=0.3;EUR_AF=0.24;AFR_AF=0.33;AMR_AF=0.46;SAS_AF=0.4;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
1 246011302 . T G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63948;AF=0.11;EAS_AF=0.13;EUR_AF=0.02;AFR_AF=0.17;AMR_AF=0.03;SAS_AF=0.17;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
1 34036669 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=68220;AF=0.06;EAS_AF=0.13;EUR_AF=0.06;AFR_AF=0.01;AMR_AF=0.03;SAS_AF=0.08;AN=6;AC=1 GT 0|0 1|0 0|0
1 106051215 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=53400;AF=0.36;EAS_AF=0.45;EUR_AF=0.31;AFR_AF=0.3;AMR_AF=0.4;SAS_AF=0.38;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|1 0|1
1 87737622 . G C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62049;AF=0.11;EAS_AF=0.25;EUR_AF=0.09;AFR_AF=0.02;AMR_AF=0.15;SAS_AF=0.08;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
1 175609041 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=69840;AF=0.38;EAS_AF=0.43;EUR_AF=0.18;AFR_AF=0.73;AMR_AF=0.16;SAS_AF=0.19;AN=6;AC=2 GT 0|1 0|1 0|0
1 205802654 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=44985;AF=0.28;EAS_AF=0.52;EUR_AF=0.28;AFR_AF=0.02;AMR_AF=0.19;SAS_AF=0.43;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|1 0|1
1 33517360 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=58323;AF=0.2;EAS_AF=0.38;EUR_AF=0.16;AFR_AF=0.02;AMR_AF=0.22;SAS_AF=0.27;AN=6;AC=1 GT 0|0 1|0 0|0
1 66794715 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57648;AF=0.43;EAS_AF=0.68;EUR_AF=0.32;AFR_AF=0.35;AMR_AF=0.48;SAS_AF=0.36;AN=6;AC=2 GT 0|0 0|1 1|0
10 106615985 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62547;AF=0.97;EAS_AF=1;EUR_AF=1;AFR_AF=0.89;AMR_AF=0.99;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
10 29389016 . G C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62685;AF=0.42;EAS_AF=0.43;EUR_AF=0.38;AFR_AF=0.45;AMR_AF=0.4;SAS_AF=0.45;AN=6;AC=3 GT 1|0 1|0 1|0
10 57223769 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=49524;AF=0.38;EAS_AF=0.19;EUR_AF=0.36;AFR_AF=0.59;AMR_AF=0.3;SAS_AF=0.37;AN=6;AC=3 GT 0|1 0|1 0|1
10 117375381 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=19428;AF=0.32;EAS_AF=0.44;EUR_AF=0.15;AFR_AF=0.4;AMR_AF=0.24;SAS_AF=0.31;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
10 80958306 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=46713;AF=0.17;EAS_AF=0.26;EUR_AF=0.23;AFR_AF=0.07;AMR_AF=0.26;SAS_AF=0.08;AN=6;AC=1 GT 0|0 1|0 0|0
10 77820346 . A AG . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=59541;AF=0.2;EAS_AF=0.23;EUR_AF=0.29;AFR_AF=0.04;AMR_AF=0.22;SAS_AF=0.3;AN=6;AC=2 GT 0|0 1|0 0|1
10 16783618 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=60513;AF=0.05;EAS_AF=0.14;EUR_AF=0.02;AFR_AF=0.01;AMR_AF=0;SAS_AF=0.06;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
10 13473335 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=85761;AF=0.57;EAS_AF=0.75;EUR_AF=0.58;AFR_AF=0.34;AMR_AF=0.62;SAS_AF=0.67;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
10 101163838 . CT C . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=52065;AF=0.43;EAS_AF=0.65;EUR_AF=0.43;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.55;SAS_AF=0.53;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
10 81646014 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=67746;AF=0.52;EAS_AF=0.47;EUR_AF=0.4;AFR_AF=0.87;AMR_AF=0.32;SAS_AF=0.36;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
11 50539930 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=67188;AF=0.3;EAS_AF=0.31;EUR_AF=0.28;AFR_AF=0.26;AMR_AF=0.25;SAS_AF=0.41;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
11 39850085 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63399;AF=0.54;EAS_AF=0.7;EUR_AF=0.7;AFR_AF=0.1;AMR_AF=0.77;SAS_AF=0.66;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|0 1|1
11 124173076 . T TTC . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=58476;AF=0.71;EAS_AF=0.73;EUR_AF=0.68;AFR_AF=0.8;AMR_AF=0.72;SAS_AF=0.59;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|0 1|1
11 29588605 . A T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62949;AF=0.01;EAS_AF=0.03;EUR_AF=0;AFR_AF=0;AMR_AF=0;SAS_AF=0.02;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
11 56515650 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=64818;AF=0.13;EAS_AF=0.13;EUR_AF=0.22;AFR_AF=0.03;AMR_AF=0.12;SAS_AF=0.16;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
11 126862585 . A C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=71319;AF=0.92;EAS_AF=1;EUR_AF=0.79;AFR_AF=0.97;AMR_AF=0.89;SAS_AF=0.93;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
11 119713564 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=28344;AF=0.85;EAS_AF=0.89;EUR_AF=0.97;AFR_AF=0.58;AMR_AF=0.95;SAS_AF=0.98;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
11 17542939 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=64458;AF=0.57;EAS_AF=0.59;EUR_AF=0.51;AFR_AF=0.65;AMR_AF=0.49;SAS_AF=0.56;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
11 88456269 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=15693;AF=0.4;EAS_AF=0.45;EUR_AF=0.49;AFR_AF=0.21;AMR_AF=0.45;SAS_AF=0.45;AN=6;AC=2 GT 0|0 1|0 1|0
11 15805009 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62748;AF=0.97;EAS_AF=1;EUR_AF=1;AFR_AF=0.88;AMR_AF=0.99;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
12 30985383 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=73698;AF=0.58;EAS_AF=0.4;EUR_AF=0.81;AFR_AF=0.45;AMR_AF=0.71;SAS_AF=0.6;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
12 95961896 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=70668;AF=0.57;EAS_AF=0.51;EUR_AF=0.5;AFR_AF=0.7;AMR_AF=0.63;SAS_AF=0.49;AN=6;AC=3 GT 0|1 0|1 1|0
12 78803544 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=86487;AF=0.34;EAS_AF=0.28;EUR_AF=0.31;AFR_AF=0.32;AMR_AF=0.34;SAS_AF=0.46;AN=6;AC=2 GT 0|1 0|1 0|0
12 17967331 . T G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=61779;AF=0.99;EAS_AF=1;EUR_AF=1;AFR_AF=0.97;AMR_AF=1;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
12 33702991 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=55392;AF=0.14;EAS_AF=0.18;EUR_AF=0.11;AFR_AF=0.18;AMR_AF=0.1;SAS_AF=0.11;AN=6;AC=2 GT 0|0 0|1 1|0
12 103790891 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=45744;AF=0.53;EAS_AF=0.89;EUR_AF=0.36;AFR_AF=0.29;AMR_AF=0.49;SAS_AF=0.68;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
12 13183433 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=68277;AF=0.41;EAS_AF=0.57;EUR_AF=0.32;AFR_AF=0.42;AMR_AF=0.49;SAS_AF=0.27;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|0 1|1
12 31753444 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=61536;AF=0.29;EAS_AF=0.27;EUR_AF=0.19;AFR_AF=0.42;AMR_AF=0.35;SAS_AF=0.17;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
12 34700693 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57639;AF=0.39;EAS_AF=0.68;EUR_AF=0.4;AFR_AF=0.04;AMR_AF=0.48;SAS_AF=0.48;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
12 16414576 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=33006;AF=0.36;EAS_AF=0.43;EUR_AF=0.31;AFR_AF=0.38;AMR_AF=0.3;SAS_AF=0.36;AN=6;AC=2 GT 0|0 0|1 1|0
13 19064731 . T A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=71928;AF=0.66;EAS_AF=0.91;EUR_AF=0.64;AFR_AF=0.45;AMR_AF=0.76;SAS_AF=0.65;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
13 31241879 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=72315;AF=0.55;EAS_AF=0.52;EUR_AF=0.73;AFR_AF=0.36;AMR_AF=0.66;SAS_AF=0.56;AN=6;AC=4 GT 0|1 1|1 0|1
13 25211713 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=71046;AF=0.01;EAS_AF=0;EUR_AF=0.02;AFR_AF=0;AMR_AF=0.03;SAS_AF=0.01;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
13 103262205 . TG T . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=55356;AF=0.65;EAS_AF=0.65;EUR_AF=0.77;AFR_AF=0.54;AMR_AF=0.61;SAS_AF=0.69;AN=6;AC=3 GT 1|0 1|0 1|0
13 90533694 . T G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=48096;AF=0.28;EAS_AF=0.24;EUR_AF=0.38;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.26;SAS_AF=0.4;AN=6;AC=2 GT 0|1 0|1 0|0
13 96881178 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=68736;AF=0.69;EAS_AF=0.68;EUR_AF=0.59;AFR_AF=0.89;AMR_AF=0.55;SAS_AF=0.65;AN=6;AC=5 GT 1|1 0|1 1|1
13 61204499 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57348;AF=0.59;EAS_AF=0.42;EUR_AF=0.48;AFR_AF=0.91;AMR_AF=0.54;SAS_AF=0.47;AN=6;AC=3 GT 0|1 0|1 0|1
13 58771508 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=50559;AF=0.9;EAS_AF=0.91;EUR_AF=0.94;AFR_AF=0.85;AMR_AF=0.93;SAS_AF=0.88;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
13 35825521 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=59184;AF=0.64;EAS_AF=0.73;EUR_AF=0.74;AFR_AF=0.4;AMR_AF=0.73;SAS_AF=0.7;AN=6;AC=4 GT 1|1 0|1 1|0
13 63406615 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=44172;AF=0.29;EAS_AF=0.23;EUR_AF=0.42;AFR_AF=0.2;AMR_AF=0.38;SAS_AF=0.29;AN=6;AC=1 GT 0|0 1|0 0|0
14 32974799 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=59139;AF=0.15;EAS_AF=0.13;EUR_AF=0.13;AFR_AF=0.15;AMR_AF=0.14;SAS_AF=0.2;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
14 87935560 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=66291;AF=0.38;EAS_AF=0.6;EUR_AF=0.35;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.44;SAS_AF=0.47;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|0 1|1
14 82794696 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=50583;AF=0.01;EAS_AF=0.05;EUR_AF=0;AFR_AF=0.01;AMR_AF=0;SAS_AF=0;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|1 1|0
14 51119020 . GTAAGTT G . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=64971;AF=0.69;EAS_AF=0.45;EUR_AF=0.72;AFR_AF=0.8;AMR_AF=0.74;SAS_AF=0.73;AN=6;AC=4 GT 1|0 0|1 1|1
14 103577878 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=49176;AF=0.22;EAS_AF=0.09;EUR_AF=0.37;AFR_AF=0.24;AMR_AF=0.22;SAS_AF=0.19;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
14 24509229 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=67707;AF=0.09;EAS_AF=0.22;EUR_AF=0.07;AFR_AF=0.04;AMR_AF=0.05;SAS_AF=0.09;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
14 62487185 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=55788;AF=0.23;EAS_AF=0.35;EUR_AF=0.21;AFR_AF=0.27;AMR_AF=0.19;SAS_AF=0.11;AN=6;AC=4 GT 1|1 1|0 0|1
14 97649991 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=70563;AF=0.66;EAS_AF=0.66;EUR_AF=0.7;AFR_AF=0.69;AMR_AF=0.51;SAS_AF=0.66;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
14 20172596 . TACTC T . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=50070;AF=0.57;EAS_AF=0.58;EUR_AF=0.52;AFR_AF=0.6;AMR_AF=0.49;SAS_AF=0.6;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
14 38978844 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=61422;AF=0.11;EAS_AF=0.21;EUR_AF=0.1;AFR_AF=0.09;AMR_AF=0.06;SAS_AF=0.08;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
15 61431969 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=64023;AF=0.67;EAS_AF=0.59;EUR_AF=0.92;AFR_AF=0.45;AMR_AF=0.57;SAS_AF=0.86;AN=6;AC=2 GT 0|0 1|0 1|0
15 52091282 . CA C . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=49539;AF=0.9;EAS_AF=0.91;EUR_AF=0.98;AFR_AF=0.76;AMR_AF=0.96;SAS_AF=0.97;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|1 0|1
15 59683738 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=54399;AF=0.37;EAS_AF=0.56;EUR_AF=0.35;AFR_AF=0.22;AMR_AF=0.39;SAS_AF=0.36;AN=6;AC=5 GT 1|1 0|1 1|1
15 68759947 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63084;AF=0.32;EAS_AF=0.36;EUR_AF=0.3;AFR_AF=0.27;AMR_AF=0.4;SAS_AF=0.31;AN=6;AC=3 GT 1|0 1|0 0|1
15 49802322 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=50313;AF=0.5;EAS_AF=0.45;EUR_AF=0.55;AFR_AF=0.56;AMR_AF=0.48;SAS_AF=0.4;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
15 85546157 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62037;AF=0.36;EAS_AF=0.37;EUR_AF=0.31;AFR_AF=0.38;AMR_AF=0.32;SAS_AF=0.42;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
15 53870685 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=73335;AF=0.19;EAS_AF=0.14;EUR_AF=0.1;AFR_AF=0.3;AMR_AF=0.26;SAS_AF=0.17;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
15 83546933 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=69225;AF=0.67;EAS_AF=0.33;EUR_AF=0.81;AFR_AF=0.84;AMR_AF=0.73;SAS_AF=0.59;AN=6;AC=3 GT 1|0 1|0 0|1
15 53406467 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=67092;AF=0.03;EAS_AF=0.13;EUR_AF=0;AFR_AF=0;AMR_AF=0.01;SAS_AF=0.01;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
15 46292328 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=59280;AF=0.64;EAS_AF=0.55;EUR_AF=0.59;AFR_AF=0.77;AMR_AF=0.56;SAS_AF=0.64;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|0 1|1
16 75466801 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=54447;AF=0.51;EAS_AF=0.56;EUR_AF=0.62;AFR_AF=0.3;AMR_AF=0.68;SAS_AF=0.48;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|1 0|0
16 936489 . A T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=59883;AF=0.03;EAS_AF=0.05;EUR_AF=0.05;AFR_AF=0;AMR_AF=0.01;SAS_AF=0.05;AN=6;AC=1 GT 0|0 1|0 0|0
16 84285133 . G C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=71202;AF=0.16;EAS_AF=0.3;EUR_AF=0.21;AFR_AF=0.01;AMR_AF=0.19;SAS_AF=0.15;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
16 65102592 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=69384;AF=0.16;EAS_AF=0.23;EUR_AF=0.11;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.23;SAS_AF=0.13;AN=6;AC=4 GT 1|1 1|0 0|1
16 4493576 . G C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=58794;AF=0;EAS_AF=0.01;EUR_AF=0;AFR_AF=0;AMR_AF=0;SAS_AF=0;AN=6;AC=2 GT 0|1 0|1 0|0
16 25640056 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=68475;AF=0.11;EAS_AF=0.15;EUR_AF=0.12;AFR_AF=0.02;AMR_AF=0.14;SAS_AF=0.16;AN=6;AC=1 GT 0|0 1|0 0|0
16 68473243 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=82104;AF=0.78;EAS_AF=0.88;EUR_AF=0.78;AFR_AF=0.67;AMR_AF=0.84;SAS_AF=0.8;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|0 1|1
16 84595721 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=72984;AF=0.6;EAS_AF=0.55;EUR_AF=0.57;AFR_AF=0.58;AMR_AF=0.63;SAS_AF=0.7;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
16 1248245 . CGGAT C . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=38817;AF=0.03;EAS_AF=0.03;EUR_AF=0.02;AFR_AF=0.05;AMR_AF=0.04;SAS_AF=0.02;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
16 82794880 . T G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=61272;AF=0.95;EAS_AF=1;EUR_AF=1;AFR_AF=0.83;AMR_AF=0.99;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
17 332140 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63501;AF=0.28;EAS_AF=0.24;EUR_AF=0.36;AFR_AF=0.1;AMR_AF=0.56;SAS_AF=0.27;AN=6;AC=2 GT 0|0 1|0 1|0
17 15196540 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57153;AF=0.41;EAS_AF=0.44;EUR_AF=0.45;AFR_AF=0.21;AMR_AF=0.43;SAS_AF=0.6;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|1 0|0
17 80557674 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=53976;AF=0.85;EAS_AF=1;EUR_AF=0.95;AFR_AF=0.56;AMR_AF=0.94;SAS_AF=0.94;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
17 31832489 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=60687;AF=0.77;EAS_AF=0.86;EUR_AF=0.76;AFR_AF=0.75;AMR_AF=0.64;SAS_AF=0.78;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
17 11488324 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=66765;AF=0.35;EAS_AF=0.5;EUR_AF=0.32;AFR_AF=0.21;AMR_AF=0.39;SAS_AF=0.36;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|1 0|1
17 61908329 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62211;AF=0.16;EAS_AF=0.03;EUR_AF=0.23;AFR_AF=0.07;AMR_AF=0.33;SAS_AF=0.2;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
17 30752030 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=56166;AF=0.16;EAS_AF=0.13;EUR_AF=0.11;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.19;SAS_AF=0.26;AN=6;AC=1 GT 0|0 1|0 0|0
17 44006958 . GC G . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=47091;AF=0.29;EAS_AF=0.71;EUR_AF=0.12;AFR_AF=0.09;AMR_AF=0.33;SAS_AF=0.29;AN=6;AC=4 GT 0|1 1|1 1|0
17 41857695 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=43593;AF=0.96;EAS_AF=1;EUR_AF=0.94;AFR_AF=0.92;AMR_AF=0.97;SAS_AF=0.99;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
17 16038446 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=61029;AF=0.31;EAS_AF=0.22;EUR_AF=0.55;AFR_AF=0.31;AMR_AF=0.39;SAS_AF=0.08;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|1 0|0
18 38854507 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=51066;AF=0.1;EAS_AF=0.11;EUR_AF=0.18;AFR_AF=0.05;AMR_AF=0.12;SAS_AF=0.05;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
18 53358159 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=51588;AF=0.16;EAS_AF=0.03;EUR_AF=0.4;AFR_AF=0.04;AMR_AF=0.23;SAS_AF=0.16;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
18 13596173 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=66894;AF=0.93;EAS_AF=0.99;EUR_AF=0.9;AFR_AF=0.9;AMR_AF=0.94;SAS_AF=0.92;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
18 67238754 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=48588;AF=0.06;EAS_AF=0.07;EUR_AF=0.11;AFR_AF=0.01;AMR_AF=0.06;SAS_AF=0.04;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|0 1|1
18 35900380 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=69585;AF=0;EAS_AF=0.02;EUR_AF=0;AFR_AF=0;AMR_AF=0;SAS_AF=0;AN=6;AC=2 GT 0|1 0|1 0|0
18 28781173 . T A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=46614;AF=0.33;EAS_AF=0.27;EUR_AF=0.57;AFR_AF=0.09;AMR_AF=0.43;SAS_AF=0.41;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
18 5112561 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=65838;AF=0.28;EAS_AF=0.48;EUR_AF=0.21;AFR_AF=0.09;AMR_AF=0.27;SAS_AF=0.41;AN=6;AC=4 GT 1|1 1|0 1|0
18 11974972 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=64284;AF=0.34;EAS_AF=0.3;EUR_AF=0.17;AFR_AF=0.55;AMR_AF=0.15;SAS_AF=0.39;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
18 27782943 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=58035;AF=0.66;EAS_AF=0.82;EUR_AF=0.65;AFR_AF=0.54;AMR_AF=0.74;SAS_AF=0.62;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|1 1|0
18 77365753 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=72117;AF=0.11;EAS_AF=0.16;EUR_AF=0.05;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.15;SAS_AF=0.08;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
19 35454277 . T G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=44091;AF=0.99;EAS_AF=1;EUR_AF=0.98;AFR_AF=1;AMR_AF=0.99;SAS_AF=0.99;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
19 32613747 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=38478;AF=0.5;EAS_AF=0.43;EUR_AF=0.67;AFR_AF=0.4;AMR_AF=0.48;SAS_AF=0.55;AN=6;AC=3 GT 0|1 0|1 1|0
19 2792130 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=61569;AF=0.36;EAS_AF=0.49;EUR_AF=0.29;AFR_AF=0.4;AMR_AF=0.26;SAS_AF=0.32;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
19 22460114 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=60402;AF=0.58;EAS_AF=0.64;EUR_AF=0.51;AFR_AF=0.39;AMR_AF=0.6;SAS_AF=0.8;AN=6;AC=3 GT 1|0 1|0 0|1
19 44901715 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57504;AF=0.48;EAS_AF=0.34;EUR_AF=0.44;AFR_AF=0.62;AMR_AF=0.55;SAS_AF=0.41;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
19 46441610 . TA T . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=45810;AF=0.48;EAS_AF=0.46;EUR_AF=0.45;AFR_AF=0.62;AMR_AF=0.35;SAS_AF=0.41;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|0 1|0
19 30108054 . A C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=43374;AF=0.46;EAS_AF=0.59;EUR_AF=0.53;AFR_AF=0.16;AMR_AF=0.58;SAS_AF=0.57;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|0 1|1
19 50693637 . CG C . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=46083;AF=1;EAS_AF=1;EUR_AF=1;AFR_AF=1;AMR_AF=1;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
19 13568845 . C CA . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=54666;AF=0.56;EAS_AF=0.64;EUR_AF=0.4;AFR_AF=0.69;AMR_AF=0.51;SAS_AF=0.54;AN=6;AC=4 GT 0|1 1|1 1|0
19 22405757 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62448;AF=0.4;EAS_AF=0.4;EUR_AF=0.47;AFR_AF=0.42;AMR_AF=0.48;SAS_AF=0.24;AN=6;AC=5 GT 1|1 0|1 1|1
2 180626608 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63237;AF=0.45;EAS_AF=0.41;EUR_AF=0.35;AFR_AF=0.57;AMR_AF=0.37;SAS_AF=0.47;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
2 241194783 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=71913;AF=0.15;EAS_AF=0.48;EUR_AF=0.01;AFR_AF=0.03;AMR_AF=0.11;SAS_AF=0.13;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
2 115121079 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=58701;AF=0.26;EAS_AF=0.35;EUR_AF=0.11;AFR_AF=0.36;AMR_AF=0.29;SAS_AF=0.18;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
2 35867074 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=58701;AF=0;EAS_AF=0.01;EUR_AF=0;AFR_AF=0;AMR_AF=0;SAS_AF=0;AN=6;AC=2 GT 0|1 0|1 0|0
2 108380806 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=66045;AF=0.23;EAS_AF=0.86;EUR_AF=0.01;AFR_AF=0;AMR_AF=0.38;SAS_AF=0.02;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
2 228378830 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=60729;AF=0.1;EAS_AF=0.27;EUR_AF=0.01;AFR_AF=0.01;AMR_AF=0.27;SAS_AF=0.03;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
2 106288000 . T G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57984;AF=0.73;EAS_AF=0.95;EUR_AF=0.7;AFR_AF=0.54;AMR_AF=0.74;SAS_AF=0.81;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
2 241934133 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=53835;AF=1;EAS_AF=1;EUR_AF=0.99;AFR_AF=1;AMR_AF=1;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
2 50580689 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=56370;AF=0.35;EAS_AF=0.54;EUR_AF=0.28;AFR_AF=0.39;AMR_AF=0.32;SAS_AF=0.2;AN=6;AC=5 GT 1|1 0|1 1|1
2 20412981 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=65808;AF=0.24;EAS_AF=0.24;EUR_AF=0.23;AFR_AF=0.26;AMR_AF=0.28;SAS_AF=0.2;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
20 5393606 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=71496;AF=0.19;EAS_AF=0.33;EUR_AF=0.24;AFR_AF=0.02;AMR_AF=0.15;SAS_AF=0.22;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
20 64103792 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=78255;AF=0.93;EAS_AF=0.94;EUR_AF=0.92;AFR_AF=0.92;AMR_AF=0.92;SAS_AF=0.95;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
20 56803383 . A AT . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=58701;AF=0.16;EAS_AF=0.29;EUR_AF=0.14;AFR_AF=0.1;AMR_AF=0.12;SAS_AF=0.14;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
20 54399488 . CAA C . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=47850;AF=0.27;EAS_AF=0.47;EUR_AF=0.14;AFR_AF=0.38;AMR_AF=0.21;SAS_AF=0.09;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
20 31234314 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=89349;AF=0.51;EAS_AF=0.76;EUR_AF=0.5;AFR_AF=0.18;AMR_AF=0.59;SAS_AF=0.67;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|1 1|0
20 50445982 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=67146;AF=0.99;EAS_AF=1;EUR_AF=0.98;AFR_AF=1;AMR_AF=0.99;SAS_AF=0.99;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
20 3453848 . C CA . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=53451;AF=0.47;EAS_AF=0.45;EUR_AF=0.67;AFR_AF=0.26;AMR_AF=0.61;SAS_AF=0.43;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 1|0
20 52602214 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=67416;AF=0.44;EAS_AF=0.39;EUR_AF=0.36;AFR_AF=0.58;AMR_AF=0.49;SAS_AF=0.34;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|0 1|1
20 56081026 . A C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=56991;AF=0.41;EAS_AF=0.48;EUR_AF=0.25;AFR_AF=0.67;AMR_AF=0.23;SAS_AF=0.31;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
20 47433646 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=61746;AF=0.32;EAS_AF=0.25;EUR_AF=0.29;AFR_AF=0.41;AMR_AF=0.42;SAS_AF=0.23;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
21 16384880 . T G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63498;AF=0.9;EAS_AF=1;EUR_AF=0.97;AFR_AF=0.74;AMR_AF=0.89;SAS_AF=0.94;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
21 38982554 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=56949;AF=0.12;EAS_AF=0.13;EUR_AF=0.07;AFR_AF=0.18;AMR_AF=0.1;SAS_AF=0.09;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
21 45442014 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=70479;AF=0.18;EAS_AF=0.16;EUR_AF=0.2;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.26;SAS_AF=0.17;AN=6;AC=1 GT 0|0 1|0 0|0
21 27929344 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=55944;AF=1;EAS_AF=1;EUR_AF=1;AFR_AF=1;AMR_AF=1;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
21 46186837 . TTTTG T . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=58860;AF=0.54;EAS_AF=0.68;EUR_AF=0.58;AFR_AF=0.41;AMR_AF=0.47;SAS_AF=0.57;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
21 37832802 . A C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62166;AF=0.88;EAS_AF=0.98;EUR_AF=0.71;AFR_AF=0.94;AMR_AF=0.81;SAS_AF=0.91;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
21 41108523 . C CA . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=44586;AF=0.46;EAS_AF=0.67;EUR_AF=0.36;AFR_AF=0.24;AMR_AF=0.58;SAS_AF=0.55;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|1 0|0
21 31059610 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=67347;AF=0.54;EAS_AF=0.37;EUR_AF=0.61;AFR_AF=0.45;AMR_AF=0.68;SAS_AF=0.63;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|0 1|1
21 17642518 . G T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=59346;AF=0.48;EAS_AF=0.45;EUR_AF=0.42;AFR_AF=0.66;AMR_AF=0.37;SAS_AF=0.4;AN=6;AC=4 GT 0|1 1|1 1|0
21 40538300 . C CA . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=57795;AF=0.39;EAS_AF=0.4;EUR_AF=0.17;AFR_AF=0.61;AMR_AF=0.34;SAS_AF=0.38;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|0 1|1
22 38192703 . A C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=77883;AF=0.16;EAS_AF=0.14;EUR_AF=0.03;AFR_AF=0.38;AMR_AF=0.04;SAS_AF=0.09;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
22 11819583 . T A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=43797;AF=0.14;EAS_AF=0.1;EUR_AF=0.05;AFR_AF=0.21;AMR_AF=0.09;SAS_AF=0.22;AN=6;AC=2 GT 0|0 0|0 1|1
22 47678312 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=64992;AF=0.7;EAS_AF=0.71;EUR_AF=0.72;AFR_AF=0.58;AMR_AF=0.75;SAS_AF=0.81;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
22 44268349 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=65412;AF=0.17;EAS_AF=0.35;EUR_AF=0.04;AFR_AF=0.13;AMR_AF=0.26;SAS_AF=0.12;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 0|1
22 20880013 . A AAAC . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=50991;AF=0.83;EAS_AF=0.73;EUR_AF=0.81;AFR_AF=0.98;AMR_AF=0.73;SAS_AF=0.83;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|1 1|0
22 38178059 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=71595;AF=0.54;EAS_AF=0.39;EUR_AF=0.46;AFR_AF=0.66;AMR_AF=0.5;SAS_AF=0.67;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
22 44186225 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=77511;AF=0.22;EAS_AF=0.27;EUR_AF=0.22;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.44;SAS_AF=0.14;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|1 1|0
22 26934727 . C CT . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=49077;AF=0.72;EAS_AF=0.94;EUR_AF=0.73;AFR_AF=0.42;AMR_AF=0.77;SAS_AF=0.85;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
22 32571148 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62922;AF=0.41;EAS_AF=0.52;EUR_AF=0.41;AFR_AF=0.26;AMR_AF=0.47;SAS_AF=0.45;AN=6;AC=4 GT 1|0 0|1 1|1
22 37213008 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=68403;AF=0.31;EAS_AF=0.58;EUR_AF=0.23;AFR_AF=0.19;AMR_AF=0.31;SAS_AF=0.28;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
3 45940627 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=67302;AF=0.93;EAS_AF=1;EUR_AF=0.8;AFR_AF=0.98;AMR_AF=0.9;SAS_AF=0.92;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
3 184628212 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=58791;AF=0.63;EAS_AF=0.69;EUR_AF=0.7;AFR_AF=0.5;AMR_AF=0.64;SAS_AF=0.68;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|1 1|0
3 127185752 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=56964;AF=0.96;EAS_AF=1;EUR_AF=0.94;AFR_AF=0.94;AMR_AF=0.96;SAS_AF=0.97;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
3 16859763 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=40044;AF=0.88;EAS_AF=0.95;EUR_AF=0.85;AFR_AF=0.83;AMR_AF=0.94;SAS_AF=0.87;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
3 115611416 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=56439;AF=0.85;EAS_AF=0.86;EUR_AF=0.93;AFR_AF=0.67;AMR_AF=0.92;SAS_AF=0.95;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|0 1|1
3 23698365 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=60681;AF=0.81;EAS_AF=0.94;EUR_AF=0.55;AFR_AF=0.96;AMR_AF=0.78;SAS_AF=0.74;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
3 122552960 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62709;AF=0.55;EAS_AF=0.79;EUR_AF=0.58;AFR_AF=0.36;AMR_AF=0.42;SAS_AF=0.63;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
3 124660794 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=574101;AF=0.6;EAS_AF=0.58;EUR_AF=0.57;AFR_AF=0.79;AMR_AF=0.53;SAS_AF=0.42;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|0 1|1
3 141426374 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=74103;AF=0.07;EAS_AF=0.21;EUR_AF=0.02;AFR_AF=0.03;AMR_AF=0.05;SAS_AF=0.05;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|0 1|1
3 80501905 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=64326;AF=0.19;EAS_AF=0.23;EUR_AF=0.26;AFR_AF=0.05;AMR_AF=0.26;SAS_AF=0.21;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
4 59572120 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57318;AF=0.29;EAS_AF=0.48;EUR_AF=0.22;AFR_AF=0.28;AMR_AF=0.14;SAS_AF=0.28;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|0 0|1
4 156645087 . CT C . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=37194;AF=0.51;EAS_AF=0.52;EUR_AF=0.55;AFR_AF=0.34;AMR_AF=0.61;SAS_AF=0.61;AN=6;AC=3 GT 1|0 1|0 1|0
4 121473964 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=46263;AF=0.66;EAS_AF=0.75;EUR_AF=0.59;AFR_AF=0.84;AMR_AF=0.52;SAS_AF=0.47;AN=6;AC=3 GT 1|0 1|0 1|0
4 186715316 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=45033;AF=0.33;EAS_AF=0.35;EUR_AF=0.2;AFR_AF=0.47;AMR_AF=0.21;SAS_AF=0.33;AN=6;AC=4 GT 1|1 1|0 1|0
4 141646450 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=66714;AF=0.77;EAS_AF=0.99;EUR_AF=0.71;AFR_AF=0.6;AMR_AF=0.79;SAS_AF=0.81;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
4 2826412 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=106632;AF=0.38;EAS_AF=0.51;EUR_AF=0.35;AFR_AF=0.36;AMR_AF=0.34;SAS_AF=0.32;AN=6;AC=4 GT 0|1 1|1 0|1
4 145597187 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=70707;AF=0.75;EAS_AF=0.5;EUR_AF=0.81;AFR_AF=0.97;AMR_AF=0.63;SAS_AF=0.75;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 1|0
4 61110667 . C CAT . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=46488;AF=0.23;EAS_AF=0.16;EUR_AF=0.26;AFR_AF=0.18;AMR_AF=0.33;SAS_AF=0.26;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
4 95780859 . A AT . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=49224;AF=0.24;EAS_AF=0.06;EUR_AF=0.13;AFR_AF=0.6;AMR_AF=0.09;SAS_AF=0.15;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 1|0
4 108837470 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=51249;AF=0.09;EAS_AF=0.24;EUR_AF=0.04;AFR_AF=0.02;AMR_AF=0.09;SAS_AF=0.08;AN=6;AC=2 GT 0|1 0|1 0|0
5 4037806 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62217;AF=0.54;EAS_AF=0.71;EUR_AF=0.5;AFR_AF=0.41;AMR_AF=0.56;SAS_AF=0.59;AN=6;AC=5 GT 1|1 0|1 1|1
5 155381414 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=51792;AF=0.18;EAS_AF=0.34;EUR_AF=0.13;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.18;SAS_AF=0.12;AN=6;AC=2 GT 0|1 1|0 0|0
5 159383785 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=30858;AF=0.93;EAS_AF=1;EUR_AF=0.85;AFR_AF=0.99;AMR_AF=0.92;SAS_AF=0.89;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
5 178840704 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=96036;AF=0.7;EAS_AF=0.59;EUR_AF=0.79;AFR_AF=0.75;AMR_AF=0.61;SAS_AF=0.71;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
5 2567454 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63891;AF=0.46;EAS_AF=0.4;EUR_AF=0.33;AFR_AF=0.72;AMR_AF=0.36;SAS_AF=0.37;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|0 1|1
5 44396965 . T A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=59193;AF=0.17;EAS_AF=0.16;EUR_AF=0.21;AFR_AF=0.03;AMR_AF=0.28;SAS_AF=0.27;AN=6;AC=4 GT 1|1 0|1 1|0
5 40027582 . A T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=70644;AF=0.24;EAS_AF=0.48;EUR_AF=0.14;AFR_AF=0.23;AMR_AF=0.21;SAS_AF=0.12;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 1|0
5 3254423 . T A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=70584;AF=0.96;EAS_AF=1;EUR_AF=1;AFR_AF=0.86;AMR_AF=0.99;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
5 180205061 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=49656;AF=0.29;EAS_AF=0.29;EUR_AF=0.27;AFR_AF=0.38;AMR_AF=0.24;SAS_AF=0.24;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 1|0
5 110686626 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62535;AF=0.11;EAS_AF=0.16;EUR_AF=0.08;AFR_AF=0.07;AMR_AF=0.03;SAS_AF=0.19;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
6 155801466 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=56613;AF=0.63;EAS_AF=0.54;EUR_AF=0.78;AFR_AF=0.55;AMR_AF=0.57;SAS_AF=0.73;AN=6;AC=1 GT 0|0 1|0 0|0
6 85903421 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=74193;AF=0.24;EAS_AF=0.35;EUR_AF=0.3;AFR_AF=0.2;AMR_AF=0.14;SAS_AF=0.16;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|1 1|0
6 168426907 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=77775;AF=0.1;EAS_AF=0.29;EUR_AF=0.01;AFR_AF=0.02;AMR_AF=0.17;SAS_AF=0.07;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
6 29852612 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=76860;AF=0.19;EAS_AF=0.23;EUR_AF=0.2;AFR_AF=0.08;AMR_AF=0.12;SAS_AF=0.33;AN=6;AC=4 GT 1|0 0|1 1|1
6 30370806 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=69072;AF=0.57;EAS_AF=0.69;EUR_AF=0.44;AFR_AF=0.69;AMR_AF=0.47;SAS_AF=0.51;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|1 1|0
6 113861983 . AT A . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=65238;AF=0.97;EAS_AF=1;EUR_AF=1;AFR_AF=0.88;AMR_AF=0.99;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
6 53837695 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=60663;AF=0.45;EAS_AF=0.66;EUR_AF=0.38;AFR_AF=0.33;AMR_AF=0.5;SAS_AF=0.45;AN=6;AC=4 GT 0|1 1|1 0|1
6 153406332 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=59175;AF=0.29;EAS_AF=0.57;EUR_AF=0.32;AFR_AF=0.04;AMR_AF=0.24;SAS_AF=0.35;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|1 0|0
6 87721995 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=55542;AF=0.12;EAS_AF=0.11;EUR_AF=0.12;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.06;SAS_AF=0.13;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|0 1|1
6 128048435 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=68979;AF=0.76;EAS_AF=0.95;EUR_AF=0.83;AFR_AF=0.38;AMR_AF=0.86;SAS_AF=0.94;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
7 63991868 . AT A . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=56376;AF=0.6;EAS_AF=0.6;EUR_AF=0.69;AFR_AF=0.58;AMR_AF=0.63;SAS_AF=0.5;AN=6;AC=5 GT 1|1 0|1 1|1
7 4174343 . A G . PASS EX_TARGET;VT=SNP;NS=150;DP=1140201;AF=0.8;EAS_AF=0.76;EUR_AF=0.73;AFR_AF=0.98;AMR_AF=0.78;SAS_AF=0.68;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
7 110779864 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=50325;AF=0;EAS_AF=0;EUR_AF=0;AFR_AF=0;AMR_AF=0;SAS_AF=0;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
7 55199779 . GC G . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=68745;AF=0.2;EAS_AF=0.48;EUR_AF=0.15;AFR_AF=0.05;AMR_AF=0.14;SAS_AF=0.22;AN=6;AC=4 GT 1|1 0|1 0|1
7 42696855 . C CTT . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=68541;AF=0.33;EAS_AF=0.43;EUR_AF=0.31;AFR_AF=0.21;AMR_AF=0.41;SAS_AF=0.35;AN=6;AC=2 GT 0|0 1|0 0|1
7 149938954 . T TA . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=19908;AF=0.76;EAS_AF=0.49;EUR_AF=0.9;AFR_AF=0.75;AMR_AF=0.8;SAS_AF=0.86;AN=6;AC=4 GT 0|1 1|1 0|1
7 70966251 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=62718;AF=0.87;EAS_AF=0.93;EUR_AF=0.97;AFR_AF=0.69;AMR_AF=0.94;SAS_AF=0.91;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
7 12334496 . A T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=50922;AF=0.7;EAS_AF=0.62;EUR_AF=0.59;AFR_AF=0.94;AMR_AF=0.7;SAS_AF=0.56;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|0 1|1
7 130983624 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=67518;AF=0.54;EAS_AF=0.37;EUR_AF=0.61;AFR_AF=0.54;AMR_AF=0.51;SAS_AF=0.67;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
7 29057532 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=53445;AF=0.76;EAS_AF=0.43;EUR_AF=0.81;AFR_AF=0.99;AMR_AF=0.81;SAS_AF=0.7;AN=6;AC=5 GT 1|1 0|1 1|1
8 92408047 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=54264;AF=0.79;EAS_AF=0.77;EUR_AF=0.79;AFR_AF=0.8;AMR_AF=0.74;SAS_AF=0.83;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
8 75239125 . A C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=61152;AF=0.79;EAS_AF=0.7;EUR_AF=0.71;AFR_AF=0.97;AMR_AF=0.72;SAS_AF=0.76;AN=6;AC=3 GT 1|0 0|0 1|1
8 97581377 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=44976;AF=0.01;EAS_AF=0.05;EUR_AF=0;AFR_AF=0;AMR_AF=0;SAS_AF=0.01;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
8 35386912 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=56538;AF=0.91;EAS_AF=1;EUR_AF=0.86;AFR_AF=0.84;AMR_AF=0.95;SAS_AF=0.92;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
8 83296119 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=55905;AF=0.09;EAS_AF=0.13;EUR_AF=0.07;AFR_AF=0.13;AMR_AF=0.07;SAS_AF=0.06;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
8 33821864 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57546;AF=0.44;EAS_AF=0.59;EUR_AF=0.4;AFR_AF=0.32;AMR_AF=0.35;SAS_AF=0.56;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
8 124257045 . A C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=70554;AF=0.42;EAS_AF=0.35;EUR_AF=0.46;AFR_AF=0.48;AMR_AF=0.47;SAS_AF=0.33;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 0|1
8 103049754 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=61398;AF=0.51;EAS_AF=0.45;EUR_AF=0.54;AFR_AF=0.51;AMR_AF=0.65;SAS_AF=0.46;AN=6;AC=5 GT 1|1 1|0 1|1
8 88874838 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63939;AF=0.79;EAS_AF=0.77;EUR_AF=0.73;AFR_AF=0.84;AMR_AF=0.78;SAS_AF=0.8;AN=6;AC=4 GT 1|0 0|1 1|1
8 117427349 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=41334;AF=0.19;EAS_AF=0.37;EUR_AF=0.26;AFR_AF=0.02;AMR_AF=0.12;SAS_AF=0.23;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|1 0|0
9 1372198 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=69717;AF=0.82;EAS_AF=0.87;EUR_AF=0.64;AFR_AF=0.98;AMR_AF=0.75;SAS_AF=0.8;AN=6;AC=4 GT 0|1 1|1 0|1
9 8960125 . A T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=65793;AF=0.95;EAS_AF=1;EUR_AF=1;AFR_AF=0.81;AMR_AF=0.97;SAS_AF=1;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
9 26584208 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=53805;AF=0.03;EAS_AF=0.05;EUR_AF=0.03;AFR_AF=0;AMR_AF=0.02;SAS_AF=0.08;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
9 4148497 . T C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=72702;AF=0.34;EAS_AF=0.15;EUR_AF=0.43;AFR_AF=0.36;AMR_AF=0.27;SAS_AF=0.49;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|1 0|0
9 85076034 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63384;AF=0.61;EAS_AF=0.72;EUR_AF=0.71;AFR_AF=0.41;AMR_AF=0.61;SAS_AF=0.64;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|0 1|1
9 60542496 . T A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=63738;AF=0.3;EAS_AF=0.61;EUR_AF=0.12;AFR_AF=0.35;AMR_AF=0.11;SAS_AF=0.21;AN=6;AC=2 GT 1|0 1|0 0|0
9 74273648 . C CA . PASS VT=INDEL;NS=150;DP=58581;AF=0.63;EAS_AF=0.88;EUR_AF=0.69;AFR_AF=0.23;AMR_AF=0.72;SAS_AF=0.78;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|0 1|1
9 80752387 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=70770;AF=0.89;EAS_AF=0.99;EUR_AF=0.83;AFR_AF=0.88;AMR_AF=0.89;SAS_AF=0.87;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
9 80630603 . C T . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57789;AF=0.29;EAS_AF=0.12;EUR_AF=0.48;AFR_AF=0.21;AMR_AF=0.28;SAS_AF=0.39;AN=6;AC=3 GT 1|0 1|0 0|1
9 104505952 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=52839;AF=0.16;EAS_AF=0.21;EUR_AF=0.11;AFR_AF=0.22;AMR_AF=0.11;SAS_AF=0.1;AN=6;AC=4 GT 1|0 1|0 1|1
X 1671571 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=48354;AF=0.49;EAS_AF=0.37;EUR_AF=0.5;AFR_AF=0.7;AMR_AF=0.42;SAS_AF=0.36;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|1 0|0
X 437228 . G C . PASS VT=SNP;NS=150;DP=35919;AF=0.2;EAS_AF=0.08;EUR_AF=0.26;AFR_AF=0.16;AMR_AF=0.31;SAS_AF=0.24;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
X 707436 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=68511;AF=0.2;EAS_AF=0.16;EUR_AF=0.23;AFR_AF=0.14;AMR_AF=0.37;SAS_AF=0.15;AN=6;AC=1 GT 0|0 0|0 1|0
X 1321378 . T A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=48123;AF=0.12;EAS_AF=0.23;EUR_AF=0.08;AFR_AF=0.07;AMR_AF=0.07;SAS_AF=0.15;AN=6;AC=2 GT 0|1 0|1 0|0
X 1000527 . T A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=16062;AF=0.41;EAS_AF=0.39;EUR_AF=0.55;AFR_AF=0.19;AMR_AF=0.47;SAS_AF=0.53;AN=6;AC=4 GT 1|1 0|1 0|1
X 1078660 . A G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=44460;AF=0.21;EAS_AF=0.21;EUR_AF=0.18;AFR_AF=0.25;AMR_AF=0.11;SAS_AF=0.25;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 1|0
X 2169054 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=69099;AF=0.81;EAS_AF=0.93;EUR_AF=0.61;AFR_AF=0.95;AMR_AF=0.72;SAS_AF=0.78;AN=6;AC=6 GT 1|1 1|1 1|1
X 1288388 . G A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=433542;AF=0.33;EAS_AF=0.46;EUR_AF=0.39;AFR_AF=0.1;AMR_AF=0.5;SAS_AF=0.33;AN=6;AC=3 GT 0|1 1|1 0|0
X 2270778 . C A . PASS VT=SNP;NS=150;DP=66909;AF=0.58;EAS_AF=0.28;EUR_AF=0.66;AFR_AF=0.8;AMR_AF=0.6;SAS_AF=0.47;AN=6;AC=2 GT 1|0 0|0 1|0
X 436608 . C G . PASS VT=SNP;NS=150;DP=57771;AF=0.36;EAS_AF=0.3;EUR_AF=0.3;AFR_AF=0.52;AMR_AF=0.32;SAS_AF=0.31;AN=6;AC=2 GT 0|0 1|0 1|0