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#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Wed Apr 8 12:32:41 2020
Programme principal et interface graphique de LIBStick
@author: yannick
"""
# pylint: disable=invalid-name, line-too-long, global-statement, unused-argument
# import tkinter, tkinter.filedialog, tkinter.ttk
# from LIBStick_IHM_extraction import *
import os
import sys
import time
import configparser
import pathlib
import gettext
import math
import tkinter as tk
import tkinter.filedialog as fd
import tkinter.font as font
import tkinter.messagebox as messagebox
import tkinter.ttk as ttk
from ttkthemes import ThemedTk
# import ttkwidgets
import numpy as np
import pandas as pd
import PIL.Image
import PIL.ImageTk
from scipy.signal import find_peaks
import LIBStick_outils
import LIBStick_traitements_spectres
import LIBStick_extraction_spectres
import LIBStick_comp_spectres
import LIBStick_ACP
import LIBStick_recherche_elements
import LIBStick_graduations
###################################################################################################
# Utilitaires pour ecriture du code
###################################################################################################
def timer_decorator(function):
def wrapper(*args, **kwargs):
start = time.perf_counter()
result = function(*args, **kwargs)
end = time.perf_counter()
print(f"La fonction {function.__name__} a été exécutée en : {end - start: .5f} secondes")
return result
return wrapper
###################################################################################################
# initialisations générales et définitions des variables globales
###################################################################################################
NOM_OS = os.name
rep_LIBStick = os.getcwd()
# print(rep_LIBStick)
#rep_NIST = "NIST_atomic_spectra"
rep_NIST = "NIST_LIBS"
flag_df_elements_L_det = False
flag_df_atomic_elements_L_rec = False
# interface graphique
flag_change_fenetre = False
flag_bouton_efface_L_trait = True
flag_bouton_efface_L_det = True
flag_ordre_trie_L_det = True
flag_bouton_efface_L_ext = True
flag_bouton_efface_L_comp = True
flag_nouvelle_ACP_L_ACP = True
flag_bouton_efface_L_ACP = True
# largeur_ecran = tk.winfo_width()
# hauteur_ecran = tk.winfo_height()
# if largeur_ecran <= 1100 :
# largeur_fenetre_principale = 1155
# hauteur_fenetre_principale = 750
# else :
# largeur_fenetre_principale = 1350
# hauteur_fenetre_principale = 790
largeur_canevas_spectres = 0
hauteur_canevas_spectres = 0
hauteur_canevas_spectres_L_det = 0
# espacement_en_pixels = 50
# multiple_du_pas_en_nm = 10
COULEUR_INTERFACE = "papaya whip"
# COULEUR_INTERFACE="linen"
# COULEUR_INTERFACE="light grey"
LARGEUR_LIGNES = 2
if NOM_OS == "posix" :
TAILLE_CASE = [3,2]
if NOM_OS == "nt" :
TAILLE_CASE = [4, 2]
# TAILLE_FONT_CLASSIFICATION = 8
# textes d'affichage de la longueur d'onde
lambda_texte_spectre_0_L_trait = lambda_texte_spectre_1_L_trait = 0
lambda_texte_spectre_0_L_det = 0
lambda_texte_spectre_L_ext = 0
lambda_texte_spectre_L_comp = 0
lambda_texte_spectre_0_L_ACP = lambda_texte_spectre_1_L_ACP = 0
# noms des fichiers et répertoires, listes des fichiers, nombre de fichiers
nom_echantillon_L_ext = ""
nom_fichier_seul_L_trait = nom_fichier_seul_L_det = nom_fichier_seul_L_ext = ""
nom_fichier_seul_L_comp = nom_fichier_seul_L_ACP = ""
rep_travail_L_trait = rep_travail_L_det = rep_travail_L_ext = rep_travail_L_comp = rep_travail_L_ACP = ""
liste_fichiers_L_trait = liste_fichiers_L_det = liste_fichiers_L_ext = liste_fichiers_L_comp = liste_fichiers_L_ACP = []
liste_bool_L_ext = []
nombre_fichiers_L_trait = nombre_fichiers_L_det = nombre_fichiers_L_ext = nombre_fichiers_L_comp = nombre_fichiers_L_ACP = 1
nombre_fichiers_avant_L_ext = 1
# gestion des zooms
minimum_spectre_L_trait = maximum_spectre_L_trait = minimum_spectre_lineaire_L_trait = 0
maximum_spectre_corrige_L_trait = 0
# maximum_spectre_ancien_L_ext = 0
# maximum_spectre_ancien_L_comp = 0
# maximum_spectre_ancien_L_ACP = 0
# identifiants des lignes
ligne0_1_L_trait = ligne0_2_L_trait = 0
ligne0_1_L_det = ligne0_2_L_det = ligne1_1_L_det = ligne1_2_L_det = 0
ligne0_1_L_ext = ligne0_2_L_ext = ligne0_3_L_ext = ligne0_4_L_ext = 0
ligne0_1_L_comp = ligne0_2_L_comp = ligne0_3_L_comp = ligne0_4_L_comp = 0
ligne0_1_L_ACP = ligne0_2_L_ACP = 0
# position des traits verticaux sur les spectres
ligne_position_0_x_L_trait = ligne_position_1_x_L_trait = 0
ligne_position_0_y_L_trait = ligne_position_1_y_L_trait = 0
ligne_position_x_L_det = ligne_position_y_L_det = 0
ligne_position_x_L_ext = ligne_position_y_L_ext = 0
ligne1_vert_L_ext = ligne1_hori_L_ext = 0
ligne2_vert_L_ext = ligne2_hori_L_ext = 0
ligne_position_x_L_comp = ligne_position_y_L_comp = 0
ligne1_vert_L_comp = ligne1_hori_L_comp = 0
ligne_position_x_L_ACP = ligne_position_y_L_ACP = ligne_position_1_L_ACP = 0
# position des graduations sur les spectres
liste_0_lignes_grad_L_trait=[]
liste_1_lignes_grad_L_trait=[]
liste_0_textes_grad_L_trait=[]
liste_1_textes_grad_L_trait=[]
liste_0_lignes_grad_L_det=[]
liste_0_textes_grad_L_det=[]
liste_0_lignes_grad_L_ext=[]
liste_0_textes_grad_L_ext=[]
liste_0_lignes_grad_L_comp=[]
liste_0_textes_grad_L_comp=[]
liste_0_lignes_grad_L_ACP=[]
liste_1_lignes_grad_L_ACP=[]
liste_0_textes_grad_L_ACP=[]
liste_1_textes_grad_L_ACP=[]
# position des lignes d'un élément sur les spectres
liste_0_lignes_element_L_trait=[]
liste_1_lignes_element_L_trait=[]
liste_0_lignes_element_L_det=[]
liste_0_lignes_element_L_ext=[]
liste_0_lignes_element_L_comp=[]
liste_0_lignes_element_L_ACP=[]
liste_1_lignes_element_L_ACP=[]
# position des pics
liste_pics_L_det = []
ligne_element_L_det = []
# identifiants des photos
image1_zoom_L_ext = image2_zoom_L_ext = image_zoom_L_comp = 0
# photo1_L_ext = photo2_L_ext = photo_L_comp = 0
# Dataframes
DataFrame_resultats_L_comp = DataFrame_complet_L_ACP = dataframe_facteurs_ACP_L_ACP = pd.DataFrame()
longueurs_onde_df_L_det = pd.DataFrame()
# treeview_columns = [_("n°"),_("Pic (nm)"), _("I du pic"), "Element", "Longueur d'onde", "I relative", _("Type"), _("Validé"), "ID"]
# dataframe_elem_detect_IDlabels_L_det = pd.DataFrame(columns=treeview_columns)
dataframe_elem_detect_IDlabels_L_det = pd.DataFrame()
spectre_dim1_L_ACP = spectre_dim2_L_ACP = spectre_dim3_L_ACP = pd.DataFrame()
DataFrame_element_L_ele = pd.DataFrame()
# identifiants des fenêtres
fenetre_recherche_elements = 0
fenetre_label_L_ACP = 0
fenetre_classification_L_ele = 0
fenetre_a_propos_L_aide = 0
# divers
texte_neutres_L_rec = texte_ions_L_rec = ""
symbole_L_ele = ""
old_time = time.time()
class CaseConfigParser(configparser.ConfigParser):
def optionxform(self, optionstr):
return optionstr
config = CaseConfigParser()
config.read("LIBStick.ini")
def lit_section_fichier_ini(section):
"""
Lit un section du fichier LIBStick.ini
"""
dictionnaire = {}
options = config.options(section)
for option in options:
try:
dictionnaire[option] = config.get(section, option)
# if dictionnaire[option] == -1:
# DebugPrint("skip: %s" % option)
except UserWarning:
print("exception on %s!" % option)
dictionnaire[option] = None
return dictionnaire
def reset_fichier_ini():
"""
Ré-initialise les valeurs par défaut du fichier LIBStick.ini
à l'aide du fichier LIBStick_reset.ini
"""
fichier = open(rep_LIBStick + "/LIBStick.ini", "w", encoding="utf-8")
fichier_reset = open(rep_LIBStick+"/LIBStick_reset.ini", "r", encoding="utf-8")
lignes = fichier_reset.readlines()
fichier.writelines(lignes)
fichier.close()
fichier_reset.close()
messagebox.showinfo(title=_("Attention !"),
message=_("Veuillez redémarrer LIBStick pour retrouver les paramètres par défaut."))
def charge_param_langue():
"""
Lit la langue au démarage du logiciel de la section LIBStick_langue
du fichier LIBStick.ini par la fonction lit_section_fichier_ini(section)
"""
dictionnaire_ini_langue = lit_section_fichier_ini("LIBStick_langue")
langue = dictionnaire_ini_langue["langue"]
return langue
langue_LIBStick = charge_param_langue()
try:
# gettext.find(langue_LIBStick)
traduction = gettext.translation(langue_LIBStick, localedir="locale",
languages=[langue_LIBStick])
traduction.install()
_ = traduction.gettext
except UnicodeTranslateError:
gettext.install("fr")
_ = gettext.gettext
def charge_param_interface():
"""
Lit le style au démarage du logiciel de la section LIBStick_interface
du fichier LIBStick.ini par la fonction lit_section_fichier_ini(section)
"""
dictionnaire_ini_interface = lit_section_fichier_ini("LIBStick_interface")
style_interface = dictionnaire_ini_interface["style"]
flag_style = dictionnaire_ini_interface["flag_couleur_LIBStick"]
return style_interface, flag_style
style_interface_LIBStick, flag_style_LIBStick_ini = charge_param_interface()
# print (style_interface_LIBStick)
# print (flag_style_LIBStick_ini)
def ecrit_fichier_ini():
"""
Sauvegarde tous les paramètres actuels du logiciel dans le fichier
LIBStick.ini sauf la langue
"""
creation_tab_bornes_L_ext()
creation_tab_bornes_L_comp()
fichier = open(rep_LIBStick + "/LIBStick.ini", "w", encoding="utf-8")
dico_sauvegarde_L_ext = {"flag_zone2_L_ext": "flag_zone2_L_ext.get()",
"flag_2D_L_ext": "flag_2D_L_ext.get()",
"flag_3D_L_ext": "flag_3D_L_ext.get()",
"flag_image_brute_L_ext": "flag_image_brute_L_ext.get()",
"borne_zone1_inf_L_ext": "tableau_bornes_L_ext[0,0]",
"borne_zone1_sup_L_ext": "tableau_bornes_L_ext[0,1]",
"borne_zone2_inf_L_ext": "tableau_bornes_L_ext[1,0]",
"borne_zone2_sup_L_ext": "tableau_bornes_L_ext[1,1]",
"rep_travail_L_ext": "rep_travail_L_ext"
}
dico_sauvegarde_L_comp = {"flag_denominateur_L_comp": "flag_denominateur_L_comp.get()",
"flag_2D_L_comp": "flag_2D_L_comp.get()",
"flag_3D_L_comp": "flag_3D_L_comp.get()",
"flag_traitement_L_comp": "flag_traitement_L_comp.get()",
"flag_stat_L_comp": "flag_stat_L_comp.get()",
"borne_zone1_inf_L_comp": "tableau_bornes_L_comp[0,0]",
"borne_zone1_sup_L_comp": "tableau_bornes_L_comp[0,1]",
"borne_zone2_inf_L_comp": "tableau_bornes_L_comp[1,0]",
"borne_zone2_sup_L_comp": "tableau_bornes_L_comp[1,1]",
"rep_travail_L_comp": "rep_travail_L_comp"
}
for section in config.sections():
if section == "LIBStick_extraction":
for option, action in dico_sauvegarde_L_ext.items():
config.set(section, str(option), str(eval(action)))
if section == "LIBStick_compare":
for option, action in dico_sauvegarde_L_comp.items():
config.set(section, str(option), str(eval(action)))
config.write(fichier)
fichier.close()
def ecrit_param_langue():
"""
Sauvegarde dans le fichier LIBStick.ini la langue
"""
fichier = open(rep_LIBStick + "/LIBStick.ini", "w", encoding="utf-8")
config.set("LIBStick_langue", "langue", langue_menu.get())
config.write(fichier)
fichier.close()
def ecrit_param_interface():
"""
Sauvegarde dans le fichier LIBStick.ini le style de l'interface
"""
fichier = open(rep_LIBStick + "/LIBStick.ini", "w", encoding="utf-8")
config.set("LIBStick_interface", "flag_couleur_LIBStick", str(flag_style_LIBStick_couleur.get()))
config.set("LIBStick_interface", "style", str(style_menu.get()))
config.write(fichier)
fichier.close()
def fenetre_pricipale_en_avant():
"""
Met au premier plan la fenetre principale mais ne la bloque pas au premier plan
"""
fenetre_principale.attributes("-topmost", True)
fenetre_principale.attributes("-topmost", False)
def mise_a_jour_affichage_onglet_actif():
onglet_actif = onglets.index(onglets.select())
if onglet_actif == 0:
mise_a_jour_affichage_L_trait()
if onglet_actif == 1:
mise_a_jour_affichage_L_det()
if onglet_actif == 2:
mise_a_jour_affichage_L_ext()
if onglet_actif == 3:
mise_a_jour_affichage_L_comp()
if onglet_actif == 4:
mise_a_jour_affichage_L_ACP()
def change_taille_fenetre(event):
"""
Applique des changements d'affichage lors du changement de la taille de la fenêtre
"""
global largeur_canevas_spectres
global hauteur_canevas_spectres
global hauteur_canevas_spectres_L_det
if largeur_ecran <= 1921 :
if fenetre_principale.winfo_width() < 1150 :
largeur_canevas_spectres = largeur_canevas_spectres_reference
else :
largeur_canevas_spectres = largeur_canevas_spectres_reference + fenetre_principale.winfo_width() - 1155
if fenetre_principale.winfo_height() < 750 :
hauteur_canevas_spectres = hauteur_canevas_spectres_reference
else :
hauteur_canevas_spectres = hauteur_canevas_spectres_reference + int((fenetre_principale.winfo_height() - 750)/2)
hauteur_canevas_spectres_L_det = int((fenetre_principale.winfo_height())-600)
else :
largeur_canevas_spectres = largeur_canevas_spectres_reference + fenetre_principale.winfo_width() - 1250
hauteur_canevas_spectres = hauteur_canevas_spectres_reference + int((fenetre_principale.winfo_height() - 770)/2)
hauteur_canevas_spectres_L_det = int((fenetre_principale.winfo_height())-600)
# if fenetre_principale.winfo_width() < 1250 :
# largeur_canevas_spectres = largeur_canevas_spectres_reference
# else :
# largeur_canevas_spectres = largeur_canevas_spectres_reference + fenetre_principale.winfo_width() - 1250
# if fenetre_principale.winfo_height() < 770 :
# hauteur_canevas_spectres = hauteur_canevas_spectres_reference
# else :
# hauteur_canevas_spectres = hauteur_canevas_spectres_reference + int((fenetre_principale.winfo_height() - 770)/2)
# hauteur_canevas_spectres_L_det = int((fenetre_principale.winfo_height())-600)
applique_change_taille_fenetre()
def applique_change_taille_fenetre():
global old_time
canevas0_L_trait.config(width=largeur_canevas_spectres, height=hauteur_canevas_spectres+170)
canevas1_L_trait.config(width=largeur_canevas_spectres, height=hauteur_canevas_spectres)
canevas0_L_det.config(width=largeur_canevas_spectres, height=hauteur_canevas_spectres_L_det)
canevas0_L_ext.config(width=largeur_canevas_spectres, height=hauteur_canevas_spectres)
canevas1_L_ext.config(width=largeur_canevas_spectres/2, height=hauteur_canevas_spectres)
canevas2_L_ext.config(width=largeur_canevas_spectres/2, height=hauteur_canevas_spectres)
canevas3_L_ext.config(width=largeur_canevas_spectres/2, height=hauteur_canevas_spectres_reference)
canevas4_L_ext.config(width=largeur_canevas_spectres/2, height=hauteur_canevas_spectres_reference)
canevas0_L_comp.config(width=largeur_canevas_spectres, height=hauteur_canevas_spectres)
canevas1_L_comp.config(width=largeur_canevas_spectres, height=hauteur_canevas_spectres)
canevas0_L_ACP.config(width=largeur_canevas_spectres, height=hauteur_canevas_spectres)
canevas1_L_ACP.config(width=largeur_canevas_spectres, height=hauteur_canevas_spectres)
cur_time = time.time()
if (cur_time - old_time) > 0.1 :
remplit_fenetres()
old_time = time.time()
def remplit_fenetres():
global flag_change_fenetre
ID_onglet = onglets.index("current")
if ID_onglet == 0:
try :
flag_change_fenetre = True
affiche_spectre_L_trait()
flag_change_fenetre = False
except :
pass
try :
flag_change_fenetre = True
affiche_spectre_corrige_L_trait()
flag_change_fenetre = False
except :
pass
try :
flag_change_fenetre = True
affiche_fond_L_trait()
flag_change_fenetre = False
except :
pass
if ID_onglet == 1:
try :
flag_change_fenetre = True
affiche_spectre_L_det()
flag_change_fenetre = False
except :
pass
if ID_onglet == 2:
try :
flag_change_fenetre = True
affiche_spectre_L_ext()
flag_change_fenetre = False
except :
pass
try :
affiche_image_L_ext()
except :
pass
try :
if flag_zone2_L_ext.get() == 0 :
affiche_spectre_moyen1_L_ext()
else :
affiche_spectre_moyen1_L_ext()
affiche_spectre_moyen2_L_ext()
except :
pass
if ID_onglet == 3:
try :
flag_change_fenetre = True
affiche_spectre_L_comp()
flag_change_fenetre = False
except :
pass
try :
affiche_image_L_comp()
except :
pass
if ID_onglet == 4:
try :
flag_change_fenetre = True
affiche_spectre_L_ACP()
flag_change_fenetre = False
except :
pass
try :
flag_change_fenetre = True
affiche_spectres_var_ACP_L_ACP()
flag_change_fenetre = False
except :
pass
def redemarre_programme():
"""Restarts the current program.
Note: this function does not return. Any cleanup action (like
saving data) must be done before calling this function."""
python = sys.executable
os.execl(python, python, * sys.argv)
###################################################################################################
###################################################################################################
# Fonctions LIBStick_IHM_traitement : onglet 1
###################################################################################################
###################################################################################################
def __________L_trait__________():
"""Fonctions LIBStick_IHM_traitement : onglet 1"""
###################################################################################################
###################################################################################################
###################################################################################################
# initialisations
###################################################################################################
def charge_param_L_trait():
"""
Initialisation des paramètres de traitement
"""
dictionnaire_ini_L_trait = lit_section_fichier_ini("LIBStick_traitement")
rep_travail = dictionnaire_ini_L_trait["rep_travail_L_trait"]
return rep_travail
rep_travail_L_trait = charge_param_L_trait()
# limites min et max de l'affichage du spectre
limites_spectre_x_L_trait = np.array([198.0, 1013.0])
# limites de l'affichage du spectre à l'écran
limites_affichage_spectre_L_trait = np.array([198.0, 1013.0])
coord_zoom_L_trait = np.array([198, 0, 1013, 0])
delta_limites_L_trait = limites_affichage_spectre_L_trait[1]-limites_affichage_spectre_L_trait[0]
flag_premier_lamda_L_trait = True
flag_dezoom_L_trait = False
flag_bouton_zoom_L_trait = False
flag_dezoom_L_ext = False
flag_bouton_zoom_L_ext = False
flag_dezoom_L_comp = False
flag_bouton_zoom_L_comp = False
flag_dezoom_L_ACP = False
flag_bouton_zoom_L_ACP = False
# flag_premier_fond_L_trait=True
spectre_entier_L_trait = np.zeros((0, 2))
fond_continu_L_trait = np.zeros((0, 2))
spectre_corrige_L_trait = np.zeros((0, 2))
tableau_bornes_L_trait = np.array([300.0, 608.0])
def affiche_nom_spectre_onglet1():
"""
Affichage de la version de LIBStick et du nom du spectre à l'écran pour l'onglet Traitement
"""
fenetre_principale.title("LIBStick v4.0"+"\t spectre : "+nom_fichier_seul_L_trait)
###################################################################################################
# fonctions traitement des données
###################################################################################################
def creation_tab_bornes_L_trait():
"""
Lecture des Spinbox et création du tableau des bornes du traitement du spectre
"""
tableau_bornes_L_trait[0] = variable_1_L_trait.get()
tableau_bornes_L_trait[1] = variable_2_L_trait.get()
return tableau_bornes_L_trait
def choix_fichier_L_trait():
"""
Ouverture/affichage d'un fichier spectre et récupération du chemin du répertoire. Bouton Fichier
"""
global nom_fichier_seul_L_trait
global rep_travail_L_trait
global liste_fichiers_L_trait
global nombre_fichiers_L_trait
nom_fichier_L_trait = fd.askopenfilename(initialdir=rep_travail_L_trait,
title=_('Choisissez un fichier spectre'),
filetypes=((_("tous"), "*.*"),
(_("fichiers LIBStick"), "*.tsv"),
(_("fichiers LIBStick moyen"), "*.mean"),
(_("fichiers IVEA"), "*.asc"),
(_("fichiers SciAps"), "*.csv")), multiple=False)
nom_fichier_seul_L_trait = os.path.basename(nom_fichier_L_trait)
type_fichier_L_trait.set(pathlib.Path(nom_fichier_seul_L_trait).suffix)
rep_travail_L_trait = os.path.dirname(nom_fichier_L_trait)
liste_fichiers_L_trait = LIBStick_outils.creation_liste_fichiers(rep_travail_L_trait,
type_fichier_L_trait.get())
nombre_fichiers_L_trait = len(liste_fichiers_L_trait)
entree_spectre_L_trait.configure(to=nombre_fichiers_L_trait)
try :
lit_affiche_spectre_L_trait(nom_fichier_seul_L_trait)
except Exception as e1 :
print(f"Fichier {nom_fichier_seul_L_trait} : mauvais format ! Supprimé de la liste ! ({e1})")
liste_fichiers_L_trait.remove(nom_fichier_seul_L_trait)
nombre_fichiers_L_trait = len(liste_fichiers_L_trait)
entree_spectre_L_trait.configure(to=nombre_fichiers_L_trait)
indices_a_supprimer = []
for numero in range(nombre_fichiers_L_trait) :
try :
nom_fichier_seul_L_trait = liste_fichiers_L_trait[numero]
lit_affiche_spectre_L_trait(nom_fichier_seul_L_trait)
break
except Exception as e2 :
print(f"Fichier {nom_fichier_seul_L_trait} : mauvais format ! Supprimé de la liste ! ({e2})")
indices_a_supprimer.append(numero)
continue
for indice in sorted(indices_a_supprimer, reverse=True):
if indice < len(liste_fichiers_L_trait):
liste_fichiers_L_trait.pop(indice)
nombre_fichiers_L_trait = len(liste_fichiers_L_trait)
entree_spectre_L_trait.configure(to=nombre_fichiers_L_trait)
bouton_visualisation_L_trait.configure(state="normal")
fenetre_principale.title("LIBStick v4.0"+"\t spectre : "+nom_fichier_seul_L_trait)
def visualisation_L_trait():
"""
Calcul et affichage du spectre traité. Bouton Visualisation
"""
global fond_continu_L_trait
global spectre_corrige_L_trait
global tableau_bornes_L_trait
tableau_bornes_L_trait = creation_tab_bornes_L_trait()
spectre_filtre_L_trait = LIBStick_traitements_spectres.creation_spectre_filtre(spectre_entier_L_trait,
tableau_bornes_L_trait,
type_filtre_L_trait.get(),
taille_filtre_L_trait.get(),
ordre_filtre_L_trait.get(),
derivee_filtre_L_trait.get())
fond_continu_L_trait = LIBStick_traitements_spectres.creation_fond(spectre_filtre_L_trait,
type_fond_L_trait.get(),
param1_fond_L_trait.get(),
param2_fond_L_trait.get(),
param3_fond_L_trait.get())
spectre_corrige_L_trait = LIBStick_traitements_spectres.creation_spectre_corrige(spectre_filtre_L_trait,
fond_continu_L_trait)
affiche_spectre_L_trait()
affiche_fond_L_trait()
affiche_spectre_corrige_L_trait()
bouton_execute_L_trait.configure(state="normal")
@timer_decorator
def execute_L_trait():
"""
Traitement et sauvegarde du/des spectre(s). Bouton Executer
"""
global liste_fichiers_L_trait
flag_tous_fichiers = flag_tous_fichiers_L_trait.get()
flag_sauve_fond = flag_sauve_fond_L_trait.get()
if flag_tous_fichiers is False:
LIBStick_traitements_spectres.execute(rep_travail_L_trait, spectre_corrige_L_trait,
fond_continu_L_trait, nom_fichier_seul_L_trait,
flag_sauve_fond)
if flag_tous_fichiers is True:
liste_fichiers_L_trait = LIBStick_traitements_spectres.execute_en_bloc(rep_travail_L_trait,
type_fichier_L_trait.get(),
liste_fichiers_L_trait,
tableau_bornes_L_trait,
type_filtre_L_trait.get(),
taille_filtre_L_trait.get(),
ordre_filtre_L_trait.get(),
derivee_filtre_L_trait.get(),
type_fond_L_trait.get(),
param1_fond_L_trait.get(),
param2_fond_L_trait.get(),
param3_fond_L_trait.get(),
flag_sauve_fond)
###################################################################################################
# fonctions graphiques du caneva du spectre (frame1_L_trait)
###################################################################################################
def lit_affiche_spectre_L_trait(nom_fichier_seul):
"""
Lecture d'un fichier spectre et affichage du spectre brut.
"""
global spectre_entier_L_trait
global limites_spectre_x_L_trait, limites_spectre_y_L_trait
global maximum_spectre_L_trait, maximum_spectre_corrige_L_trait
global fond_continu_L_trait
os.chdir(rep_travail_L_trait)
spectre_entier_L_trait = LIBStick_outils.lit_spectre(nom_fichier_seul,
type_fichier_L_trait.get())
limites_spectre_x_L_trait, limites_spectre_y_L_trait = lit_limites_L_trait(spectre_entier_L_trait)
maximum_spectre_L_trait = maximum_spectre_corrige_L_trait = limites_spectre_y_L_trait[1]
affiche_spectre_L_trait()
fond_continu_L_trait = np.zeros((spectre_entier_L_trait.shape[0], 2))
def lit_limites_L_trait(spectre):
"""
Lit les limites hautes et basses d'un spectre
et fixe les valeurs du zoom à ces valeurs min et max
"""
# tableau_abscisses = spectre[:, 0]
# tableau_ordonnees = spectre[:, 1].max()
limites_spectre_x = np.zeros((2))
limites_spectre_x[0] = spectre[0, 0] # lit les abscisses min et max du spectre
limites_spectre_x[1] = spectre[-1, 0]
limites_spectre_y = np.zeros((2))
limites_spectre_y[0] = spectre[:, 1].min() # lit les valeurs min et max du spectre
limites_spectre_y[1] = spectre[:, 1].max()
# fixe les valeurs du zoom à ces valeurs min et max
variable_zoom_inf_L_trait.set(limites_spectre_x[0])
variable_zoom_sup_L_trait.set(limites_spectre_x[1])
# fixe les valeurs limites pour le zoom et la zone de selection
entree_zoom_inf_L_trait.configure(from_=limites_spectre_x[0], to=limites_spectre_x[1])
entree_zoom_sup_L_trait.configure(from_=limites_spectre_x[0], to=limites_spectre_x[1])
# entree_zoom_inf_L_trait.configure(from_=limites_spectre[0], to=limites_spectre[1])
# entree_zoom_sup_L_trait.configure(from_=limites_spectre[0], to=limites_spectre[1])
entree1_L_trait.configure(from_=limites_spectre_x[0], to=limites_spectre_x[1])
entree2_L_trait.configure(from_=limites_spectre_x[0], to=limites_spectre_x[1])
return limites_spectre_x,limites_spectre_y
def affiche_lambda_L_trait(event):
"""
Affiche la valeur de la longueur d'onde sur les spectres
des canevas 0 et 1 et dans la zone de texte dédiée
"""
global lambda_texte_spectre_0_L_trait
global lambda_texte_spectre_1_L_trait
global flag_premier_lamda_L_trait
global lambda_elements
if flag_premier_lamda_L_trait is False:
canevas0_L_trait.delete(lambda_texte_spectre_0_L_trait)
canevas1_L_trait.delete(lambda_texte_spectre_1_L_trait)
l = event.x*delta_limites_L_trait/largeur_canevas_spectres+limites_affichage_spectre_L_trait[0]
lambda_recherche_elements_L_rec.set(l)
lambda_texte_spectre_0_L_trait = canevas0_L_trait.create_text(event.x,
event.y,
text=str(format(l, "4.1f")), fill="blue")
lambda_texte_spectre_1_L_trait = canevas1_L_trait.create_text(event.x,
event.y,
text=str(format(l, "4.1f")), fill="blue")
lambda_texte_L_trait.configure(text="Lambda = " + str(format(l, "4.2f") + " nm"))
flag_premier_lamda_L_trait = False
def affiche_position_souris_0_L_trait(event):
"""
Affiche la position du curseur sur les canevas 0 et 1 lors du déplacement
sous la forme d'un trait vert verticale si zoom y en automatique
sous la forme de deux traits verts vertical et horizontal si pas zoom y auto
"""
global ligne_position_0_x_L_trait
global ligne_position_1_x_L_trait
global ligne_position_0_y_L_trait
global ligne_position_1_y_L_trait
canevas0_L_trait.delete(ligne_position_0_x_L_trait)
canevas0_L_trait.delete(ligne_position_0_y_L_trait)
ligne_position_0_x_L_trait = canevas0_L_trait.create_line(event.x, 0, event.x, hauteur_canevas_spectres+170, fill="green")
if flag_zoom_auto_y.get() is False:
ligne_position_0_y_L_trait = canevas0_L_trait.create_line(0, event.y, largeur_canevas_spectres, event.y, fill="green")
canevas1_L_trait.delete(ligne_position_1_x_L_trait)
canevas1_L_trait.delete(ligne_position_1_y_L_trait)
ligne_position_1_x_L_trait = canevas1_L_trait.create_line(event.x, 0, event.x, hauteur_canevas_spectres, fill="green")
if flag_zoom_auto_y.get() is False:
ratio_y0 = event.y/(hauteur_canevas_spectres+170)
ligne_position_1_y_L_trait = canevas1_L_trait.create_line(0, ratio_y0*hauteur_canevas_spectres,
largeur_canevas_spectres, ratio_y0*hauteur_canevas_spectres,
fill="green")
l = event.x*delta_limites_L_trait/largeur_canevas_spectres+limites_affichage_spectre_L_trait[0]
lambda_texte_L_trait.configure(text="Lambda = " + str(format(l, "4.2f") + " nm"))
def affiche_position_souris_motion_0_L_trait(event):
"""
Affiche la position du curseur et la valeur de lambda
sur les canevas 0 et 1 lors du déplacement avec clic droit maintenu
sous la forme d'un trait vert verticale si zoom y en automatique
sous la forme de deux traits verts vertical et horizontal si pas zoom y auto
"""
global ligne_position_0_x_L_trait
global ligne_position_1_x_L_trait
global ligne_position_0_y_L_trait
global ligne_position_1_y_L_trait
global lambda_texte_spectre_0_L_trait
global lambda_texte_spectre_1_L_trait
global flag_premier_lamda_L_trait
canevas0_L_trait.delete(ligne_position_0_x_L_trait)
canevas0_L_trait.delete(ligne_position_0_y_L_trait)
ligne_position_0_x_L_trait = canevas0_L_trait.create_line(event.x, 0, event.x, hauteur_canevas_spectres+170, fill="green")
if flag_zoom_auto_y.get() is False:
ligne_position_0_y_L_trait = canevas0_L_trait.create_line(0, event.y, largeur_canevas_spectres, event.y, fill="green")
canevas1_L_trait.delete(ligne_position_1_x_L_trait)
canevas1_L_trait.delete(ligne_position_1_y_L_trait)
ligne_position_1_x_L_trait = canevas1_L_trait.create_line(event.x, 0, event.x, hauteur_canevas_spectres, fill="green")
if flag_zoom_auto_y.get() is False:
ratio_y0 = event.y/(hauteur_canevas_spectres+170)
ligne_position_1_y_L_trait = canevas1_L_trait.create_line(0, ratio_y0*hauteur_canevas_spectres,
largeur_canevas_spectres, ratio_y0*hauteur_canevas_spectres,
fill="green")
if flag_premier_lamda_L_trait is False:
canevas0_L_trait.delete(lambda_texte_spectre_0_L_trait)
canevas1_L_trait.delete(lambda_texte_spectre_1_L_trait)
l = event.x*delta_limites_L_trait/largeur_canevas_spectres+limites_affichage_spectre_L_trait[0]
lambda_recherche_elements_L_rec.set(l)
lambda_texte_spectre_0_L_trait = canevas0_L_trait.create_text(event.x,
event.y,
text=str(format(l, "4.1f")), fill="blue")
lambda_texte_spectre_1_L_trait = canevas1_L_trait.create_text(event.x,
event.y,
text=str(format(l, "4.1f")), fill="blue")
lambda_texte_L_trait.configure(text="Lambda = " + str(format(l, "4.2f") + " nm"))
flag_premier_lamda_L_trait = False
def affiche_spectre_L_trait():
"""
Affichage du spectre dans le canevas 0 avec gestion du zoom y auto ou non
"""
global limites_affichage_spectre_L_trait
global delta_limites_L_trait
global minimum_spectre_lineaire_L_trait
global minimum_spectre_L_trait
global maximum_spectre_L_trait
global flag_echelle_log_L_trait
limites_affichage_spectre_L_trait[0] = variable_zoom_inf_L_trait.get()
limites_affichage_spectre_L_trait[1] = variable_zoom_sup_L_trait.get()
# gestion du zoom avec y personnalisé
if flag_zoom_auto_y.get() is False and flag_dezoom_L_trait is False and flag_bouton_zoom_L_trait is False :
spectre = np.zeros((0, 2))
for ligne in spectre_entier_L_trait:
if (ligne[0] >= limites_affichage_spectre_L_trait[0] and ligne[0] <= limites_affichage_spectre_L_trait[1]):
spectre = np.row_stack((spectre, ligne))
minimum_spectre_L_trait = spectre[:, 1].min()
coord_y_min = min(coord_zoom_L_trait[1],coord_zoom_L_trait[3])
coord_y_min = coord_y_min*(hauteur_canevas_spectres+170)/hauteur_canevas_spectres
# print("coord_y0_min = " + str(coord_y_min))
ratio_y_0_max = (hauteur_canevas_spectres+170-coord_y_min)/(hauteur_canevas_spectres+170)
if flag_change_fenetre is False :
maximum = maximum_spectre_L_trait * ratio_y_0_max
# maximum = (maximum_spectre_L_trait-minimum_spectre_L_trait) * ratio_y_0_max
maximum_spectre_L_trait = maximum
else :
maximum = maximum_spectre_L_trait
delta_limites_L_trait = limites_affichage_spectre_L_trait[1] - limites_affichage_spectre_L_trait[0]
canevas0_L_trait.delete("all")
spectre = np.zeros((0, 2))
for ligne in spectre_entier_L_trait:
if (ligne[0] >= limites_affichage_spectre_L_trait[0] and ligne[0] <= limites_affichage_spectre_L_trait[1]):
spectre = np.row_stack((spectre, ligne))
if flag_echelle_log_L_trait.get() is True :
spectre[spectre<0] = 0
minimum_spectre_lineaire_L_trait = spectre[:, 1].min()
spectre[:,1] = np.log(spectre[:,1]-spectre[:, 1].min()+1)
minimum_spectre_L_trait = minimum = spectre[:, 1].min()
# gestion du zoom avec y personnalisé par les boutons de zoom
if flag_zoom_auto_y.get() is False and flag_dezoom_L_trait is False and flag_bouton_zoom_L_trait is True:
maximum = maximum_spectre_L_trait
delta_limites_L_trait = limites_affichage_spectre_L_trait[1] - limites_affichage_spectre_L_trait[0]
canevas0_L_trait.delete("all")
spectre = np.zeros((0, 2))
for ligne in spectre_entier_L_trait:
if (ligne[0] >= limites_affichage_spectre_L_trait[0] and ligne[0] <= limites_affichage_spectre_L_trait[1]):
spectre = np.row_stack((spectre, ligne))
if flag_echelle_log_L_trait.get() is True :
spectre[spectre<0] = 0
minimum_spectre_lineaire_L_trait = spectre[:, 1].min()
spectre[:,1] = np.log(spectre[:,1]-spectre[:, 1].min()+1)
minimum_spectre_L_trait = minimum = spectre[:, 1].min()
# gestion du zoom avec y automatique
if flag_zoom_auto_y.get() is True or flag_dezoom_L_trait is True:
delta_limites_L_trait = limites_affichage_spectre_L_trait[1] - limites_affichage_spectre_L_trait[0]
canevas0_L_trait.delete("all")
spectre = np.zeros((0, 2))
for ligne in spectre_entier_L_trait:
if (ligne[0] >= limites_affichage_spectre_L_trait[0] and ligne[0] <= limites_affichage_spectre_L_trait[1]):
spectre = np.row_stack((spectre, ligne))
if flag_echelle_log_L_trait.get() is True :
spectre[spectre<0] = 0
minimum_spectre_lineaire_L_trait = spectre[:, 1].min()
spectre[:,1] = np.log(spectre[:,1]-spectre[:, 1].min()+1)
minimum_spectre_L_trait = minimum = spectre[:, 1].min()
maximum_spectre_L_trait = maximum = spectre[:, 1].max()
# dessin du spectre
spectre[:, 1] = (hauteur_canevas_spectres+170-(spectre[:, 1] - minimum)*(hauteur_canevas_spectres+170)/(maximum - minimum))
spectre[:, 0] = (spectre[:, 0] - limites_affichage_spectre_L_trait[0]) * \
largeur_canevas_spectres/delta_limites_L_trait
for i in range(len(spectre) - 1):
canevas0_L_trait.create_line(spectre[i, 0], spectre[i, 1], spectre[i+1, 0], spectre[i+1, 1])
affiche_lignes_spectre_L_trait()
# ajout des graduations
affiche_graduation_L_trait()
affiche_lignes_element_L_ele()
def affiche_fond_L_trait():
"""
Affichage du fond continu du spectre dans le canevas 0
"""
limites_affichage_spectre_L_trait[0] = variable_zoom_inf_L_trait.get()
limites_affichage_spectre_L_trait[1] = variable_zoom_sup_L_trait.get()
spectre = np.zeros((0, 2))
for ligne in fond_continu_L_trait:
if (ligne[0] >= limites_affichage_spectre_L_trait[0] and ligne[0] <= limites_affichage_spectre_L_trait[1]):
spectre = np.row_stack((spectre, ligne))
minimum = minimum_spectre_L_trait
maximum = maximum_spectre_L_trait
if flag_echelle_log_L_trait.get() is True :
spectre[:,1] = np.log(spectre[:,1]-minimum_spectre_lineaire_L_trait)
spectre[:, 1] = (hauteur_canevas_spectres+170-(spectre[:, 1] - minimum)*(hauteur_canevas_spectres+170)/(maximum - minimum))
spectre[:, 0] = (spectre[:, 0] - limites_affichage_spectre_L_trait[0]) * \
largeur_canevas_spectres/delta_limites_L_trait
for i in range(len(spectre) - 1):
canevas0_L_trait.create_line(spectre[i, 0], spectre[i, 1],
spectre[i+1, 0], spectre[i+1, 1], fill="blue")
# flag_premier_fond_L_trait = False
def affiche_graduation_L_trait():
"""
Affichage des graduations dans les canevas 0 et 1
"""
global liste_0_lignes_grad_L_trait
global liste_0_textes_grad_L_trait
global liste_1_lignes_grad_L_trait
global liste_1_textes_grad_L_trait
liste_graduations_en_nm, liste_graduations_en_pixels = LIBStick_graduations.calcul_tableaux_graduation(largeur_canevas_spectres,
limites_affichage_spectre_L_trait,
espacement_en_pixels.get(),
multiple_du_pas_en_nm.get())
for ligne in liste_0_lignes_grad_L_trait :
canevas0_L_trait.delete(ligne)
# canevas0_L_trait.delete(texte)
liste_0_lignes_grad_L_trait=[]
# liste_0_textes_grad_L_trait=[]
for x in liste_graduations_en_pixels :
liste_0_lignes_grad_L_trait.append(canevas0_L_trait.create_line(x, 0, x, hauteur_canevas_spectres+170,
fill="blue", dash=(1,2)))
for texte in liste_0_textes_grad_L_trait :
canevas0_L_trait.delete(texte)
liste_0_textes_grad_L_trait=[]
for i in range(len(liste_graduations_en_pixels)) :
liste_0_textes_grad_L_trait.append(canevas0_L_trait.create_text(liste_graduations_en_pixels[i], 10,
text=str(format(liste_graduations_en_nm[i], "4.1f")),
fill="blue"))
for ligne in liste_1_lignes_grad_L_trait :
canevas1_L_trait.delete(ligne)
# canevas0_L_trait.delete(texte)
liste_1_lignes_grad_L_trait=[]
# liste_1_textes_grad_L_trait=[]
for x in liste_graduations_en_pixels :
liste_1_lignes_grad_L_trait.append(canevas1_L_trait.create_line(x, 0, x, hauteur_canevas_spectres+170,
fill="blue", dash=(1,2)))
for texte in liste_1_textes_grad_L_trait :
canevas1_L_trait.delete(texte)
liste_1_textes_grad_L_trait=[]
for i in range(len(liste_graduations_en_pixels)) :
liste_1_textes_grad_L_trait.append(canevas1_L_trait.create_text(liste_graduations_en_pixels[i], 10,
text=str(format(liste_graduations_en_nm[i], "4.1f")),
fill="blue"))
def mise_a_jour_affichage_L_trait() :
affiche_spectre_L_trait()
affiche_fond_L_trait()
def affiche_lignes_spectre_L_trait():
"""
Affichages des limites du traitement sur le spectre sous forme de deux lignes
rouges verticales. Les valeurs sont fixées par les spinbox borne inf. et borne sup.
"""
global ligne0_1_L_trait
global ligne0_2_L_trait
x_ligne0_1 = ((variable_1_L_trait.get() -
limites_affichage_spectre_L_trait[0])*largeur_canevas_spectres/delta_limites_L_trait)
x_ligne0_2 = ((variable_2_L_trait.get() -
limites_affichage_spectre_L_trait[0])*largeur_canevas_spectres/delta_limites_L_trait)
ligne0_1_L_trait = canevas0_L_trait.create_line(
x_ligne0_1, 0, x_ligne0_1, hauteur_canevas_spectres+170, fill="red", width=LARGEUR_LIGNES)
ligne0_2_L_trait = canevas0_L_trait.create_line(
x_ligne0_2, 0, x_ligne0_2, hauteur_canevas_spectres+170, fill="red", width=LARGEUR_LIGNES)
def deplace_lignes_L_trait():
"""
Déplace les lignes rouges des limites inf et sup sur le canevas 0
"""
deplace_ligne0_1_L_trait()
deplace_ligne0_2_L_trait()
def deplace_ligne0_1_L_trait():