diff --git a/docs/99-archive/reports/architecture-audit-2026-03-04/00-audit-baseline.md b/docs/99-archive/reports/architecture-audit-2026-03-04/00-audit-baseline.md
new file mode 100644
index 000000000..d97d61933
--- /dev/null
+++ b/docs/99-archive/reports/architecture-audit-2026-03-04/00-audit-baseline.md
@@ -0,0 +1,356 @@
+# Architecture Audit Report
+
+Date: 2026-03-04
+Scope: `src/bioetl`, `tests/architecture`, `configs/quality`, проектные правила в `docs/00-project/*`.
+
+## Executive Summary
+
+- Total findings: 6
+- Critical (MUST): 0
+- Moderate (SHOULD): 4
+- Informational (MAY): 2
+- Архитектурные guardrails сильные: `tests/architecture` проходят полностью (1439 passed, 21 skipped).
+- Главный ограничитель развития — накопленный управляемый техдолг в метриках структуры (485 exemption entries в scorecard baseline).
+
+## 10-category scorecard
+
+| Категория                                             | Что оценивается                                                               |  Вес | Оценка (1–10) | Взвешенный балл |
+| ----------------------------------------------------- | ----------------------------------------------------------------------------- | ---: | ------------: | --------------: |
+| 1. Слоистая архитектура                               | Чистота зависимостей domain/application/infrastructure/interfaces/composition | 0.14 |           8.8 |            1.23 |
+| 2. Hexagonal (Ports & Adapters) + DDD                 | Порты в domain, адаптеры в infrastructure, DI и инверсия зависимостей         | 0.12 |           8.3 |            1.00 |
+| 3. Модульность и связность                            | Размер модулей, уровни связности, наличие god-object рисков                   | 0.11 |           6.4 |            0.70 |
+| 4. Качество доменной модели                           | Чистота domain, выраженность value objects / contracts / invariants           | 0.10 |           7.4 |            0.74 |
+| 5. Тестирование и архитектурные гейты                 | Полнота unit/integration/e2e/architecture, стабильность quality-gates         | 0.11 |           9.2 |            1.01 |
+| 6. Обработка ошибок и устойчивость                    | Circuit breaker, retries, degradation patterns, fail-fast политика            | 0.08 |           7.8 |            0.62 |
+| 7. Логирование и наблюдаемость                        | Структурированные логи, trace/metrics порты, run-context observability        | 0.08 |           8.4 |            0.67 |
+| 8. Производительность и масштабируемость              | Асинхронность, батчинг, память/чекпоинты/производительность пайплайнов        | 0.08 |           7.2 |            0.58 |
+| 9. Безопасность и секреты                             | Работа с credential/env vars, PII hashing, sanitization                       | 0.08 |           8.1 |            0.65 |
+| 10. Документация, технический долг и сопровождаемость | Актуальность docs, явность правил, debt budgets/exemptions                    | 0.10 |           6.1 |            0.61 |
+
+**Интегральный балл**: **7.81 / 10**
+
+### Интерпретация
+
+- **0–4.9**: критическое состояние
+- **5.0–7.9**: рабочее, но ограниченное техдолгом
+- **8.0–10**: зрелая архитектура
+
+Текущее состояние: **верхняя граница “5.0–7.9”** — архитектура дисциплинированная и активно защищена тестами, но общий балл сдерживается размером и сложностью части модулей и большим количеством оформленных исключений из quality-метрик.
+
+______________________________________________________________________
+
+## Архитектурная оценка по запросу
+
+### 1) Соблюдение слоистой структуры
+
+- Позитив: в `tests/architecture/test_layer_dependencies.py` зафиксированы запреты на infra/imports в domain и на импорты concrete-adapters в application.
+- Позитив: `tests/architecture` green (1439 passed).
+- Вывод: критичных нарушений слоёв в текущем baseline не обнаружено.
+
+### 2) Следование Ports & Adapters и DDD
+
+- Позитив: фасад портов централизован в `src/bioetl/domain/ports/__init__.py`.
+- Позитив: архитектурные тесты отдельно валидируют контракты портов/адаптеров (`test_port_contracts.py`, `test_adapter_contracts.py`).
+- Риск: размер composition/application модулей усложняет безопасную эволюцию адаптеров и use-case orchestration.
+
+### 3) Явность границ модулей и зависимостей
+
+- Позитив: формализованная import discipline + CI-гейты.
+- Риск: high fan-in/fan-out в крупных factory/transformer/config модулях (см. findings P2 ниже).
+
+### 4) Единообразие naming и структуры пакетов
+
+- Позитив: naming проверяется архитектурными тестами (`test_naming_conventions.py`), явная пакетная сегрегация слоёв.
+- Риск: часть модулей содержит “технически валидную”, но перегруженную ответственность (configuration + orchestration + helper logic в одном файле).
+
+______________________________________________________________________
+
+## Findings
+
+## [Moderate (P2)] F-001: Большой объём архитектурных exemption снижает реальную скорость улучшений
+
+**Location**: `configs/quality/debt_scorecard.yaml`, `configs/quality/architecture_metric_exemptions.yaml`
+
+**Rule**: SHOULD — управляемое сокращение техдолга по квартальным бюджетам.
+
+**Evidence**:
+
+- baseline фиксирует **485** total exemptions.
+- распределение по registry: file_size_limits/function_complexity/function_length/class_size/god_object/domain_complexity.
+- значительная доля с единым горизонтом истечения (2026-04-30), что формирует «долговой cliff».
+
+**Impact**:
+
+- затруднён приоритет реального рефакторинга;
+- локальные изменения имеют повышенный риск hidden coupling;
+- интегральный балл архитектуры искусственно ограничен.
+
+**Recommendation**:
+
+- Ввести wave-based debt burn-down (по 3–5 hotspot модулей/спринт);
+- отделить обязательные от условных exemption с owner-level SLA;
+- метрика успеха: -20% exemptions за 2 квартала.
+
+**Verification command**: `uv run python - <<'PY' ... parse YAML ... PY`
+
+## [Moderate (P2)] F-002: Крупные composition/application/domain модули создают локальные “god object” зоны
+
+**Location**:
+
+- `src/bioetl/composition/factories/pipeline_factory.py` (789 LOC)
+- `src/bioetl/application/core/base_transformer.py` (622 LOC)
+- `src/bioetl/domain/composite/config.py` (1152 LOC)
+- `src/bioetl/composition/factories/storage_adapter.py` (734 LOC)
+
+**Rule**: SHOULD — высокая связность и низкая когнитивная нагрузка модулей.
+
+**Evidence**:
+
+- `wc -l` подтверждает размеры выше типовых limits слоёв;
+- архитектурный реестр exemption содержит отдельные записи для file_size/god_object/function_length.
+
+**Impact**:
+
+- рост стоимости изменения;
+- сложность точечных unit-тестов;
+- повышенный риск регрессий при расширении pipeline-сценариев.
+
+**Recommendation**:
+
+- выделить sub-factories/sub-services, перенести pure-функции в отдельные helper modules;
+- ввести композицию через Protocol/ABC на уровне orchestration steps.
+
+**Verification command**: `wc -l ... && grep -c ...`
+
+## [Moderate (P2)] F-003: Тест quality-gate допускает высокий baseline long-functions
+
+**Location**: `tests/architecture/test_code_metrics.py`
+
+**Rule**: SHOULD — снижать допуски на длину функций по плану.
+
+**Evidence**:
+
+- `MAX_VIOLATIONS = 165` для функций >50 строк;
+- комментарии в тесте отражают рост baseline и расширение допусков.
+
+**Impact**:
+
+- green build не гарантирует реального улучшения readability;
+- long functions закрепляются как “новая норма”.
+
+**Recommendation**:
+
+- переводить budget в ratchet-модель (например, 165 -> 145 -> 120 по кварталам);
+- добавить threshold на “new violations == 0” + “total decreases each quarter”.
+
+**Verification command**: `sed -n '1,220p' tests/architecture/test_code_metrics.py`
+
+## [Moderate (P2)] F-004: Частичное смешение orchestration и инфраструктурных деталей в крупных factory модулях
+
+**Location**: `src/bioetl/composition/factories/pipeline_factory.py`
+
+**Rule**: SHOULD — composition слой собирает зависимости, но не должен концентрировать чрезмерно много runtime-вариативности в одном модуле.
+
+**Evidence**:
+
+- модуль содержит большое число импортов из application/composition/domain/infrastructure;
+- единая точка с множеством обязанностей: assembly, config extraction, runner wiring.
+
+**Impact**:
+
+- модуль становится изменяемым по многим причинам (SRP pressure);
+- повышается риск конфликтов при параллельной разработке.
+
+**Recommendation**:
+
+- разрезать на bounded factory units (runner_assembly, dq_assembly, source_assembly, versioning_assembly);
+- оставить в `pipeline_factory.py` только façade orchestration.
+
+**Verification command**: `rg -n "^from |^import " src/bioetl/composition/factories/pipeline_factory.py`
+
+## [Informational (P3)] F-005: Сильная архитектурная автоматизация — важный актив проекта
+
+**Location**: `tests/architecture/*`
+
+**Evidence**:
+
+- 1460 архитектурных тестов, 1439 passed, 21 skipped;
+- покрываются границы слоёв, naming, medallion invariants, observability ограничения, policy contracts.
+
+**Impact**:
+
+- снижает вероятность грубых архитектурных регрессов;
+- упрощает безопасный инкрементальный рефакторинг.
+
+## [Informational (P3)] F-006: Типобезопасность поддерживается на высоком уровне
+
+**Location**: `src/bioetl/*`
+
+**Evidence**:
+
+- `uv run python -m mypy --strict src/bioetl/` -> Success (606 source files).
+
+**Impact**:
+
+- хороший фундамент для безопасного рефакторинга и выделения интерфейсов.
+
+______________________________________________________________________
+
+## Приоритизированный план рефакторинга
+
+### P0 / Шаг 1 — Декомпозиция hotspot-модулей (первый wave)
+
+**Цель**: снизить когнитивную сложность и размер критических файлов.
+
+**Конкретные правки**:
+
+- `pipeline_factory.py`: выделить `runner_assembler.py`, `dq_assembler.py`, `source_assembler.py`.
+- `base_transformer.py`: вынести независимые этапы (column normalization, schema harmonization, quality hooks) в strategy-пакет.
+- `domain/composite/config.py`: разделить на `seed_config.py`, `dependency_config.py`, `enricher_config.py`, `execution_policy.py` с re-export в фасаде.
+
+**Риски**:
+
+- поломка импортов и сериализации конфигов;
+- поведение “тихо поменялось” из-за изменения порядка шагов.
+
+**Снижение рисков**:
+
+- contract tests на публичные dataclass/Protocol интерфейсы;
+- golden snapshot тесты конфигураций;
+- временный compatibility shim через `__init__.py` re-export.
+
+**Критерии готово**:
+
+- -15% LOC в каждом hotspot;
+- 0 новых exemption;
+- architecture + mypy green.
+
+### P0 / Шаг 2 — Debt scorecard ratchet
+
+**Цель**: перевести quality-gate из “держим baseline” в “обязательное снижение”.
+
+**Конкретные правки**:
+
+- `configs/quality/debt_scorecard.yaml`: целевые budgets на Q2/Q3 с минимум -8..10% по size_shape registries.
+- `tests/architecture/test_code_metrics.py`: зафиксировать “new long-functions = 0”, уменьшить `MAX_VIOLATIONS` поэтапно.
+
+**Риски**:
+
+- рост красных CI в коротком горизонте.
+
+**Снижение рисков**:
+
+- staged rollout: warning->block только после 1 спринта стабилизации;
+- исключения только с RF-id + expires_on.
+
+**Критерии готово**:
+
+- baseline exemptions \<= 440;
+- автоматический отчёт debt trend в CI artifacts.
+
+### P1 / Шаг 3 — Явные интерфейсы orchestration steps
+
+**Цель**: снизить связность между orchestration компонентами и implementation деталями.
+
+**Конкретные правки**:
+
+- В application/composition ввести `Protocol` для шагов: preflight, extract, transform, load, postrun.
+- Унифицировать фабрики шагов через typed factories (`*Factory`) без runtime ветвления в одном модуле.
+
+**Риски**:
+
+- дублирование интерфейсов или слишком “тонкие” абстракции.
+
+**Снижение рисков**:
+
+- ADR-lite (короткое решение) на границы каждого нового Protocol;
+- ограничить стартовый scope 2-3 pipeline family.
+
+**Критерии готово**:
+
+- уменьшение import fan-out в `pipeline_factory.py` минимум на 30%;
+- unit tests на каждый step port.
+
+### P1 / Шаг 4 — Консолидация общей логики адаптеров
+
+**Цель**: уменьшить дубли в fetch/search/health/request-sanitization.
+
+**Конкретные правки**:
+
+- Вынести общие request building blocks в `infrastructure/adapters/common` (already present, расширить использование).
+- Для PubMed/OpenAlex/SemanticScholar унифицировать retry/backoff/circuit integration в mixin/service слой.
+
+**Риски**:
+
+- provider-specific edge cases могут “размыться”.
+
+**Снижение рисков**:
+
+- provider-contract tests + VCR кассеты per provider;
+- feature flags на rollout общей логики.
+
+**Критерии готово**:
+
+- сокращение дублирующегося кода по target adapters (проверка через duplication scan);
+- стабильный integration test baseline.
+
+### P2 / Шаг 5 — Документация и architecture decision hygiene
+
+**Цель**: удержать прозрачность эволюции архитектуры.
+
+**Конкретные правки**:
+
+- добавить “Refactoring Wave Board” в docs с RF-id, owners, deadlines;
+- обновить runbook по рефакторингу крупных модулей и правилам внесения exemption.
+
+**Риски**:
+
+- документация устаревает быстрее кода.
+
+**Снижение рисков**:
+
+- CI check на синхронизацию версии правил и scorecard targets.
+
+**Критерии готово**:
+
+- все активные exemption имеют owner + expiry + removal_step;
+- отчёт волны рефакторинга публикуется в каждом релизном цикле.
+
+______________________________________________________________________
+
+## Какие метрики и тесты добавить/обновить
+
+1. **Architecture Fitness KPIs (обязательные)**
+
+   - `exemptions_total` (цель: устойчивое снижение QoQ)
+   - `hotspot_files_over_limit` (цель: снижение count)
+   - `import_fanout_hotspots` (цель: снижение top-10)
+   - `new_long_function_violations` (цель: всегда 0)
+
+1. **Новые/обновлённые тесты**
+
+   - test that **new exemptions forbidden** without RF-id и expiry;
+   - ratchet test: квартальный budget must be \<= previous quarter;
+   - fan-in/fan-out budget tests для composition hotspots;
+   - mutation/snapshot tests для composite config decomposition.
+
+1. **Связка с интегральным баллом (прогноз)**
+
+   - После Шагов 1–2:
+     - Категория 3 (модульность): 6.4 -> 7.6
+     - Категория 10 (долг/сопровождаемость): 6.1 -> 7.2
+     - Категория 8 (масштабируемость): 7.2 -> 7.8
+   - Прогноз интегрального балла: **7.81 -> ~8.35**
+
+______________________________________________________________________
+
+## Verification Log (commands)
+
+- `uv run python -m pytest tests/architecture/ -v`
+- `uv run python -m mypy --strict src/bioetl/`
+- `find src/bioetl -name '*.py' -print0 | xargs -0 wc -l | sort -nr | head -25`
+- `uv run python - <<'PY' ... architecture_metric_exemptions stats ... PY`
+- `wc -l src/bioetl/composition/factories/pipeline_factory.py src/bioetl/application/core/base_transformer.py src/bioetl/domain/composite/config.py src/bioetl/composition/factories/storage_adapter.py`
+- `grep -c "^def \|^async def \|^class " ...`
+- `rg -n "^from |^import " src/bioetl/composition/factories/pipeline_factory.py | head -40`
+- `sed -n '1,220p' tests/architecture/test_code_metrics.py`